RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 SLC2A10O95528 541 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 ADH4P08319 380 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 CST2P09228 141 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 TUBG1P23258 451 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 PCGF2P35227 344 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 MPV17P39210 176 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 MTNR1AP48039 350 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 MMP15P51511 669 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 ERVK-25P63136 954 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 PSG4Q00888 419 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 SNCBQ16143 134 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 ESCO2Q56NI9 601 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 MTX3Q5HYI7 312 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 FAM27BQ5VT28 67 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 C16orf87Q6PH81 154 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 SPATC1Q76KD6 591 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.15□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 TMEM239Q8WW34 195 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 C4orf45Q96LM5 186 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 SH3GL1Q99961 368 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 OR2H1Q9GZK4 316 aa7.15□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 MSL2Q9HCI7 577 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.15□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.15□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 A0A1W2PPL8 197 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 C5orf63A6NC05 138 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 A6NIZ1 184 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 KRT34O76011 436 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ABHD16AO95870 558 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 NGFP01138 241 aa7.14□□□□□ -1.27
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TROAP-208ENST00000548817 IGHMP01871 453 aa7.14□□□□□ -1.27
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TROAP-208ENST00000548817 LAP3P28838 519 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 WNT5AP41221 380 aa7.14□□□□□ -1.27
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TROAP-208ENST00000548817 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 RAG2P55895 527 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 RAP1BP61224 184 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 RAP1AP62834 184 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 FMODQ06828 376 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ZNF154Q13106 437 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 LAPTM4AQ15012 233 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 PDCD1Q15116 288 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 VMACQ2NL98 169 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ALG10Q5BKT4 473 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ZNF774Q6NX45 483 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 NKAIN4Q8IVV8 208 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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TROAP-208ENST00000548817 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 PFN4Q8NHR9 129 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 MRAPQ8TCY5 172 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 TSPEARQ8WU66 669 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 TMEM255BQ8WV15 326 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 TAMM41Q96BW9 452 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 SAMD8Q96LT4 415 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 COG8Q96MW5 612 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 SEPHS2Q99611 448 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ECSITQ9BQ95 431 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 WACQ9BTA9 647 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.14□□□□□ -1.27
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