RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 MED20Q9H944 212 aa16.11■□□□□ 0.17
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PUF60-218ENST00000531995 HMGN1P05114 100 aa16.1■□□□□ 0.17
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PUF60-218ENST00000531995 SSX4O60224 188 aa16.08■□□□□ 0.16
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PUF60-218ENST00000531995 ZNF35P13682 527 aa16.06■□□□□ 0.16
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PUF60-218ENST00000531995 CENPAP49450 140 aa16.06■□□□□ 0.16
PUF60-218ENST00000531995 NUDT6P53370 316 aa16.06■□□□□ 0.16
PUF60-218ENST00000531995 HIST1H3AP68431 136 aa16.06■□□□□ 0.16
PUF60-218ENST00000531995 TRIP10Q15642 601 aa16.06■□□□□ 0.16
PUF60-218ENST00000531995 LRRC36Q1X8D7 754 aa16.06■□□□□ 0.16
PUF60-218ENST00000531995 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa16.06■□□□□ 0.16
PUF60-218ENST00000531995 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PUF60-218ENST00000531995 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa16.06■□□□□ 0.16
PUF60-218ENST00000531995 TMEM53Q6P2H8 277 aa16.06■□□□□ 0.16
PUF60-218ENST00000531995 SLC22A25Q6T423 547 aa16.06■□□□□ 0.16
PUF60-218ENST00000531995 B3GLCTQ6Y288 498 aa16.06■□□□□ 0.16
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