RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NUCB1Q02818 461 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RCAN2Q14206 197 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF77Q15935 545 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TPGS2Q68CL5 300 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C11orf88Q6PI97 169 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CENPUQ71F23 418 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LYPD6Q86Y78 171 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MINDY2Q8NBR6 621 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 B3GNT7Q8NFL0 401 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR10D4PQ8NGN7 298 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR10J6PQ8NGY7 276 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBE2E3Q969T4 207 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HIGD2AQ9BW72 106 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RHBDL2Q9NX52 303 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HMGXB4Q9UGU5 601 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANGPT4Q9Y264 503 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ABCA4P78363 2273 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPIPA7E9PJI5 369 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSD17B6O14756 317 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CTSLP07711 333 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPIPA8P0DM63 369 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRPS1L1P21108 318 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GFERP55789 205 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDK16Q00536 496 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF767PQ75MW2 155 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MSRB3Q8IXL7 192 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 METTL13Q8N6R0 699 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM184AQ8NB25 1140 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR4M1Q8NGD0 313 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR4K13Q8NH42 304 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSMA8Q8TAA3 256 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPATA13Q96N96 652 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ODF3Q96PU9 254 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RARRES2Q99969 163 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TCHPQ9BT92 498 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ECT2Q9H8V3 914 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HMG20BQ9P0W2 317 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CTNNA3Q9UI47 895 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RWDD2AQ9UIY3 292 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNXBP22105 4242 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KNCNA6PVL3 124 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A8MXQ7 604 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SDHDO14521 159 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MGRN1O60291 552 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PAHP00439 452 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPN2P04844 631 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIF5BP33176 963 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CASP3P42574 277 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAGEA12P43365 314 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CASP4P49662 377 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RORCP51449 518 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRMT2P55345 433 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DUSP7Q16829 419 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTPN20Q4JDL3 420 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 THEM4Q5T1C6 240 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 H3F3CQ6NXT2 135 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PAGE2Q7Z2X7 111 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DPY19L4Q7Z388 723 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TAF8Q7Z7C8 310 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SBSPONQ8IVN8 264 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLEC4FQ8N1N0 589 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EID2Q8N6I1 236 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM133AQ8N9E0 248 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 Q8NAQ8 132 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR52H1Q8NGJ2 320 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM54Q969K7 222 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF2Q99496 336 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PITX2Q99697 317 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAIM2Q9BWQ8 316 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAMD10Q9BYL1 202 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATG10Q9H0Y0 220 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CYSTM1Q9H1C7 97 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 METTL7AQ9H8H3 244 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UFSP2Q9NUQ7 469 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANK2Q01484 3957 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1B0GU33 70 aa-0.89□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms