RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.5□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.5□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.5□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.5□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.49□□□□□ -1.37
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UBE2B-204ENST00000504431 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.49□□□□□ -1.37
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UBE2B-204ENST00000504431 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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UBE2B-204ENST00000504431 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.49□□□□□ -1.37
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UBE2B-204ENST00000504431 SLC43A2Q8N370 569 aa6.49□□□□□ -1.37
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UBE2B-204ENST00000504431 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.49□□□□□ -1.37
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UBE2B-204ENST00000504431 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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UBE2B-204ENST00000504431 OTULINQ96BN8 352 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 C7orf34Q96L11 122 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 PRRC1Q96M27 445 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 PIGMQ9H3S5 423 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 C12orf10Q9HB07 376 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 CHST11Q9NPF2 352 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 MED29Q9NX70 200 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 NDE1Q9NXR1 346 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 RNF7Q9UBF6 113 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.49□□□□□ -1.37
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UBE2B-204ENST00000504431 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.49□□□□□ -1.37
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UBE2B-204ENST00000504431 ZNF724A8MTY0 619 aa6.48□□□□□ -1.37
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UBE2B-204ENST00000504431 HSPB6O14558 160 aa6.48□□□□□ -1.37
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UBE2B-204ENST00000504431 UPK3AO75631 287 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 SEMG1P04279 462 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 CRHP06850 196 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 ADORA3P0DMS8 318 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 IGHV1-2P23083 117 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 UGT2B10P36537 528 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 CD79BP40259 229 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 AQP2P41181 271 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 GPR4P46093 362 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 OR3A2P47893 321 aa6.48□□□□□ -1.37
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UBE2B-204ENST00000504431 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 NIPAL3Q6P499 406 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 LINGO2Q7L985 606 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 OR51A7Q8NH64 312 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 APH1AQ96BI3 265 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 S100PBPQ96BU1 408 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 SGTBQ96EQ0 304 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 EPYCQ99645 322 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.48□□□□□ -1.37
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