RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PPQ1 181 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NUDT19A8MXV4 375 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 J3KTA2 159 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SCDO00767 359 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FFAR1O14842 300 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 REM1O75628 298 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ALDOBP05062 364 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SCG5P05408 212 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 UBBP0CG47 229 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NPIPA8P0DM63 369 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PRKACGP22612 351 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CDKN1BP46527 198 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DAPP51397 102 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF136P52737 540 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CDH12P55289 794 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CXADRP78310 365 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ST3GAL3Q11203 375 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 C1orf185Q5T7R7 199 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FAHD1Q6P587 224 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CNIH2Q6PI25 160 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DTX1Q86Y01 620 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 BEST4Q8NFU0 473 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF138Q8WVD3 245 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 C3orf49Q96BT1 292 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DDOQ99489 341 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MCHR1Q99705 422 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FUZQ9BT04 418 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PN81 502 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ALG1L2C9J202 215 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRTM2O43300 516 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SSNA1O43805 119 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SUSD5O60279 629 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GFRA3O60609 400 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SEMA7AO75326 666 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CDRT1O95170 752 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CHRNA7P36544 502 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RFX3P48380 749 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PPT1P50897 306 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TAS2R41P59536 307 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RAP2BP61225 183 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 IL18Q14116 193 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RTP5Q14D33 572 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DCST1Q5T197 706 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF613Q6PF04 617 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NKD1Q969G9 470 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CHST5Q9GZS9 411 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RASL12Q9NYN1 266 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MYOTQ9UBF9 498 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2AT4A6NND4 320 aa6.51□□□□□ -1.37
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