RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM9BQ9NQ34 198 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 CD5LO43866 347 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 LSM8O95777 96 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 CD160O95971 181 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 OR1E1P30953 314 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN8P56748 225 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN18P56856 261 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf31Q8N9H6 132 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 UVRAGQ9P2Y5 699 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PRD5 423 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 AKR7A2O43488 359 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 RAD51CO43502 376 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 FCN3O75636 299 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 AQP8O94778 261 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 HBE1P02100 147 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 CLTAP09496 248 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 SLC1A2P43004 574 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 DOC2AQ14183 400 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 NPSR1Q6W5P4 371 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 GALNT14Q96FL9 552 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 BLZF1Q9H2G9 400 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 PIGUQ9H490 435 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 PXMP2Q9NR77 195 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 AHSPQ9NZD4 102 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 OR12D3Q9UGF7 316 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 PSG8Q9UQ74 426 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GW55 424 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 CTRB1P17538 263 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 GGT1P19440 569 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 RND2P52198 227 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP10-3P60369 221 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 GGTLC2Q14390 218 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 HADHQ16836 314 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 NOXO1Q8NFA2 376 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP90Q8TF47 636 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf72Q96LT7 481 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM38AQ9H6F2 299 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 DUX4Q9UBX2 424 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM120BA0PK00 339 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 FLOT1O75955 427 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-DPB1P04440 258 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 IFNW1P05000 195 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF138P52744 262 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 RAB11AP62491 216 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 IRF8Q02556 426 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 RAB11BQ15907 218 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 TSPO2Q5TGU0 170 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 GPR107Q5VW38 600 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01551Q86U37 167 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS58Q8IYP2 241 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 Q8N976 141 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 OR52E5Q8NH55 327 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 NTAN1Q96AB6 310 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 CEP170P1Q96L14 293 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 BMFQ96LC9 184 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 BEX1Q9HBH7 125 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 CLN6Q9NWW5 311 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 UBN2Q6ZU65 1347 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN11A1L157 253 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 GABARAPO95166 117 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 CEACAM3P40198 252 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 CSNK1A1P48729 337 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ARG2P78540 354 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ERCC8Q13216 396 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ARL9Q6T311 187 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 OR56A4Q8NGH8 313 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 APH1BQ8WW43 257 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 NOX3Q9HBY0 568 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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