RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487476.5

NF1-211, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NF1, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-211ENST00000487476 ITGA5P08648 1049 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 GAAP10253 952 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 LAP3P28838 519 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 SLC15A1P46059 708 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 TPTEP56180 551 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 TSC22D1Q15714 1073 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 DNM1P34Q6PK57 102 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ATCAYQ86WG3 371 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 CCDC120Q96HB5 630 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 EMC7Q9NPA0 242 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 MOKQ9UQ07 419 aa14.83□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 IL18BPO95998 194 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 PTHP01270 115 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 B4GALT1P15291 398 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 OPRM1P35372 400 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ARF1P84077 181 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 GLO1Q04760 184 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 SGCAQ16586 387 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 Q6ZT83 130 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 NABP1Q96AH0 204 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 A0A096LPE4 126 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 A0A1W2PPZ6 126 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 CD8BP10966 210 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 NR2C1P13056 603 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 IGHV1-2P23083 117 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 HSF2Q03933 536 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 TIGD4Q8IY51 512 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 POC5Q8NA72 575 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 OR51E2Q9H255 320 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.82□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 LYZL6O75951 148 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 CDSNQ15517 529 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 LRRC18Q8N456 261 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 STX19Q8N4C7 294 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 FOXB1Q99853 325 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 MPGP29372 298 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ZNF84P51523 738 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 KCNJ8Q15842 424 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 CENPOQ9BU64 300 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.81□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 SNTNA6NMZ2 147 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 A8MXE2 369 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 SBK2P0C263 348 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 SPNP16150 400 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ATP6V1E1P36543 226 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ST3GAL4Q11206 333 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 GGTLC2Q14390 218 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 CORO6Q6QEF8 472 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 KLHL24Q6TFL4 600 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 RFLNBQ8N5W9 214 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 TBX5Q99593 518 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 J3QRE1 110 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 DVL2O14641 736 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 GSTT2P0CG29 244 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 GSTT2BP0CG30 244 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 RGS6P49758 472 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ADAM8P78325 824 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 IRF3Q14653 427 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 CARTPTQ16568 116 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 C4orf17Q53FE4 359 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 INTS14Q96SY0 518 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 NELFAQ9H3P2 528 aa14.8□□□□□ -0.04
NF1-211ENST00000487476 MARCH7Q9H992 704 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms