RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481410.1

C7orf49-208, human

TSL 2

Gene C7orf49, Length 976 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C7orf49-208	ENST00000481410	NMNAT3	Q96T66	252 aa		11.1	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	SOX7	Q9BT81	388 aa		11.1	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		11.1	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	OR6C68	A6NDL8	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	SHISA9	B4DS77	424 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410		H7C1C5	153 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	SURF4	O15260	269 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	REN	P00797	406 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	IFNG	P01579	166 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	HMGN1	P05114	100 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	NPR2	P20594	1047 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	NOS3	P29474	1203 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	SLC25A1	P53007	311 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	LCN6	P62502	163 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	EFNB1	P98172	346 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	MYBPC1	Q00872	1141 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	NPRL3	Q12980	569 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	RIPK1	Q13546	671 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	GGTLC2	Q14390	218 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	GINS1	Q14691	196 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	PPA1	Q15181	289 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	RAB35	Q15286	201 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	KCNMB1	Q16558	191 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	FAM27B	Q5VT28	67 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	AGAP6	Q5VW22	663 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	C12orf73	Q69YU5	71 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	LEG1	Q6P5S2	330 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	ZNF75A	Q96N20	296 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	RDH12	Q96NR8	316 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	SLC29A1	Q99808	456 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	WAC	Q9BTA9	647 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	NUAK2	Q9H093	628 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	FN3K	Q9H479	309 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	OCEL1	Q9H607	264 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	SIAE	Q9HAT2	523 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		11.09	□□□□□ -0.63
C7orf49-208	ENST00000481410	DCTN6	O00399	190 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	BAG2	O95816	211 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	WNT11	O96014	354 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	IGKV3-15	P01624	115 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	IGLV1-44	P01699	117 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	GAA	P10253	952 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	B4GALT1	P15291	398 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	ZNF3	P17036	446 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	RAD23A	P54725	363 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	CRMP1	Q14194	572 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	TREML4	Q6UXN2	200 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	OR6V1	Q8N148	313 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	EME1	Q96AY2	570 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	MUCL1	Q96DR8	90 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	POLE4	Q9NR33	117 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	B9D1	Q9UPM9	204 aa		11.08	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	SLC16A7	O60669	478 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	LY6H	O94772	140 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	UBL3	O95164	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	CBR1	P16152	277 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	MSR1	P21757	451 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	POU1F1	P28069	291 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	LAP3	P28838	519 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	EPHA2	P29317	976 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	CENPA	P49450	140 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	TRIP10	Q15642	601 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	SYT9	Q86SS6	491 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	OR2T4	Q8NH00	348 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		11.07	□□□□□ -0.64
C7orf49-208	ENST00000481410	PITX2	Q99697	317 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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