RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481356.1

SRPRB-203, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 1,487 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-203ENST00000481356 UCP2P55851 309 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 FLOT2Q14254 428 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 NKPD1Q17RQ9 610 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 MICAQ29983 383 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 HS3ST5Q8IZT8 346 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 OR6V1Q8N148 313 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 CYB561A3Q8NBI2 242 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 OR10G2Q8NGC3 310 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 POFUT1Q9H488 388 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 GPR160Q9UJ42 338 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 B9D1Q9UPM9 204 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 POMPQ9Y244 141 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 CDH10Q9Y6N8 788 aa9.5□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 OR6C68A6NDL8 312 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 M0R233 179 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 SNAP29O95721 258 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 NGFP01138 241 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 GAAP10253 952 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 PCSK6P29122 969 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 PYCR1P32322 319 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 MPV17P39210 176 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 HTR5AP47898 357 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 PDLIM4P50479 330 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 PPP2R2BQ00005 443 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 CORO6Q6QEF8 472 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 ARL9Q6T311 187 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 LINC00346Q8IVM7 164 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 IQCF1Q8N6M8 205 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 ABHD4Q8TB40 342 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 SNX33Q8WV41 574 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 SLCO4A1Q96BD0 722 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 TSSK6Q9BXA6 273 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 REV1Q9UBZ9 1251 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 ABCA1O95477 2261 aa9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 AQP12BA6NM10 295 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 INAFM1C9JVW0 142 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 BHLHE40O14503 412 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 ARPC3O15145 178 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 RER1O15258 196 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 SGCEO43556 437 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 SYNGR3O43761 229 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 HLA-DQA2P01906 255 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 MT-ND5P03915 603 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 DBHP09172 617 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 PSKH1P11801 424 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 APEHP13798 732 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 DAOP14920 347 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 CRABP1P29762 137 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 RASSF2P50749 326 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 CBX1P83916 185 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 SCRN3Q0VDG4 424 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 GGTLC2Q14390 218 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 AQP12AQ8IXF9 295 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 OR51L1Q8NGJ5 315 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 SYNPRQ8TBG9 265 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 GIPC3Q8TF64 312 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 FEVQ99581 238 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 BCL2L14Q9BZR8 327 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 YY1AP1Q9H869 796 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 LHFPL6Q9Y693 200 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 TANC2Q9HCD6 1990 aa9.48□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 TVP23AA6NH52 213 aa9.47□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 FKBP6O75344 327 aa9.47□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 E2F6O75461 281 aa9.47□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 TIPRLO75663 272 aa9.47□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 NCR1O76036 304 aa9.47□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 TFP02787 698 aa9.47□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 HPXP02790 462 aa9.47□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 GYPBP06028 91 aa9.47□□□□□ -0.89
SRPRB-203ENST00000481356 SLC25A16P16260 332 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms