RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 DHHO43323 396 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 TBX19O60806 448 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 PTP4A3O75365 173 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 SEC22BO75396 215 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 PPP1R3DO95685 299 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 FGF4P08620 206 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 RRASP10301 218 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 LAMP1P11279 417 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 HPGDP15428 266 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 SPNP16150 400 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 PGCP20142 388 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 GATA3P23771 443 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 PRPH2P23942 346 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 SLC6A2P23975 617 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 MYL9P24844 172 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 DIO1P49895 249 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 P2RX1P51575 399 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 VBP1P61758 197 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 FUT5Q11128 374 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 PTGR1Q14914 329 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 MLC1Q15049 377 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 KANK2Q63ZY3 851 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 CORO6Q6QEF8 472 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 MISPQ8IVT2 679 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 WDR31Q8NA23 367 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 ARL5BQ96KC2 179 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 RNF121Q9H920 327 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 GP6Q9HCN6 339 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 IFT46Q9NQC8 304 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 C1orf109Q9NX04 203 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 MALT1Q9UDY8 824 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 ING4Q9UNL4 249 aa6.77□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF98A6NK75 572 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 GJE1A6NN92 205 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF724A8MTY0 619 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 VSTM5A8MXK1 200 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 B9A039 149 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 FCMRO60667 390 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 CRCPO75575 148 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 CLIC3O95833 236 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 C6orf47O95873 294 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 LGI1O95970 557 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 NGFP01138 241 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 CHRNGP07510 517 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 CSF1P09603 554 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 LINC00032P0C843 101 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 BCKDHAP12694 445 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 PSMB9P28065 219 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 PCGF2P35227 344 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 TGFBR2P37173 567 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 HAAOP46952 286 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 GSK3BP49841 420 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 ARHGDIAP52565 204 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 RAC3P60763 192 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 BTG1P62324 171 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 EMX2Q04743 252 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 GABRA6Q16445 453 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 MAPK14Q16539 360 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 MST1LQ2TV78 715 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 SYT14P1Q58G82 188 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM65Q6PI78 240 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 TEX261Q6UWH6 196 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 DPP10Q8N608 796 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 AGR3Q8TD06 166 aa6.76□□□□□ -1.33
SZRD1-208ENST00000476423 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms