RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468108.1

CCDC66-211, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-211	ENST00000468108	ARPC3	O15145	178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	SURF4	O15260	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	PRKY	O43930	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	NPIPB7	O75200	414 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ENTPD6	O75354	484 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CBR3	O75828	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CCNK	O75909	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	NDUFB2	O95178	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CH25H	O95992	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	BGLAP	P02818	100 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108		P04436	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	STS	P08842	583 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	PEPD	P12955	493 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	LIF	P15018	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CNR1	P21554	472 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	GAL	P22466	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	FXYD6P3	P58550	94 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	SCN1B	Q07699	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ASAH1	Q13510	395 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	GPR50	Q13585	617 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF74	Q16587	644 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	PGGHG	Q32M88	737 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	OR2M3	Q8NG83	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	DDIT4L	Q96D03	193 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC22A4	Q9H015	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	UBQLN3	Q9H347	655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	FN3K	Q9H479	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	PROK2	Q9HC23	129 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	SSR3	Q9UNL2	185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108		B4DXG7	233 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	MYL12B	O14950	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	GMFG	O60234	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CACNA1H	O95180	2353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	AHSA1	O95433	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	PTH	P01270	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	IFNG	P01579	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	YES1	P07947	543 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CD14	P08571	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CCL3	P10147	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF17	P17021	662 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ITGA3	P26006	1051 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CAPZA2	P47755	286 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	RAB25	P57735	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	OR2B6	P58173	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CFHR3	Q02985	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	LTB	Q06643	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	RAB40B	Q12829	278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ZP4	Q12836	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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