RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.34□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.34□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.34□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.34□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TENM4Q6N022 2769 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RELNP78509 3460 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 H0YJX3 145 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ENTPD6O75354 484 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 GLCEO94923 617 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CST2P09228 141 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 GNAO1P09471 354 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PSKH1P11801 424 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP3CBP16298 524 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 IGFBP2P18065 325 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 GABRB1P18505 474 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC2A5P22732 501 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXC12P31275 282 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 FMO3P31513 532 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 IL5RAQ01344 420 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 HSF2Q03933 536 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 GLO1Q04760 184 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNMB1Q16558 191 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM27BQ5VT28 67 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF691Q5VV52 312 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CORO6Q6QEF8 472 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MDP1Q86V88 176 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 P2RY8Q86VZ1 359 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC26A10Q8NG04 563 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TFAP2CQ92754 450 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MUCL1Q96DR8 90 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXO17Q96EF6 278 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MISP3Q96FF7 219 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 BOD1Q96IK1 185 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TEAD3Q99594 435 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR76Q9H967 626 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 B3GNT2Q9NY97 397 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MOKQ9UQ07 419 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 C12orf71A8MTZ7 269 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 H0YAE9 185 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 M0R1B8 84 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CASKO14936 926 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PRODHO43272 600 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SELENOFO60613 162 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 UBL3O95164 117 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CELA3BP08861 270 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SPARCP09486 303 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 COX6B1P14854 86 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CBR1P16152 277 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF823P16415 610 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF32P17041 273 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 NUDT6P53370 316 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 HCCSP53701 268 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CDH11P55287 796 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB1AP62820 205 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ADAM8P78325 824 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PSG4Q00888 419 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB39AQ14964 217 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 GSG1Q2KHT4 349 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC36A2Q495M3 483 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 NRN1LQ496H8 165 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM53Q6P2H8 277 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 USP51Q70EK9 711 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 GID4Q8IVV7 300 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ACBD4Q8NC06 268 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SETD9Q8NE22 299 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 OR6N2Q8NGY6 317 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CNIH3Q8TBE1 160 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM222BQ8WU58 562 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms