RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438265.5

RPE-211, Transcript of ribulose-5-phosphate-3-epimerase, humanhuman

TSL 3

Gene RPE, Length 668 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE-211ENST00000438265 SLC22A25Q6T423 547 aa7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 NSMAFQ92636 917 aa7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 NMNAT3Q96T66 252 aa7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 NUAK2Q9H093 628 aa7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 FN3KQ9H479 309 aa7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 C8orf4Q9NR00 106 aa7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.14□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 A0A1W2PPL8 197 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 VSTM5A8MXK1 200 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 H3BNX3 289 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 H7C1C5 153 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 PRODHO43272 600 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 SOX14O95416 240 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 HLA-HP01893 362 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 BMP4P12644 408 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 ZNF35P13682 527 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 IGFBP5P24593 272 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 APLNRP35414 380 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 CRISP1P54107 249 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 LCN6P62502 163 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 TUBA1BP68363 451 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 TUBA4AP68366 448 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 CDK5Q00535 292 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 GALK2Q01415 458 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 HSF2Q03933 536 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 NPRL3Q12980 569 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 ETFDHQ16134 617 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 AGAP6Q5VW22 663 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 TUBA1AQ71U36 451 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 SLC26A10Q8NG04 563 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 OR4K13Q8NH42 304 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 STMN2Q93045 179 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 DDOQ99489 341 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 RNF121Q9H920 327 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 S100A14Q9HCY8 104 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 KRT84Q9NSB2 600 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 USE1Q9NZ43 259 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 B9D1Q9UPM9 204 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 MOKQ9UQ07 419 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.13□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 OR6C68A6NDL8 312 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 VWC2LB2RUY7 222 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 SURF4O15260 269 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 CELA3BP08861 270 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 ZNF32P17041 273 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 NR4A1P22736 598 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 IL2RGP31785 369 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 CDAP32320 146 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 GLRXP35754 106 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 EVX1P49640 407 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 ERFP50548 548 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 DAPP51397 102 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 NUDT6P53370 316 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 RAD23AP54725 363 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 HIST1H3AP68431 136 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 RAB35Q15286 201 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 EFNB3Q15768 340 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 SGCAQ16586 387 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 PCK2Q16822 640 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 MSMPQ1L6U9 139 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 TEX30Q5JUR7 227 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 ARL9Q6T311 187 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 ZNF584Q8IVC4 421 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.12□□□□□ -1.27
RPE-211ENST00000438265 OR6V1Q8N148 313 aa7.12□□□□□ -1.27
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