RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 PPP2R2BQ00005 443 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 SNAPC1Q16533 368 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 MEP1BQ16820 701 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 IGFBPL1Q8WX77 278 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 CIB1Q99828 191 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 ORC6Q9Y5N6 252 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 C5orf49A4QMS7 147 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 DOK2O60496 412 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 OR4A8P0C604 315 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 GLRXP35754 106 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 RAD52P43351 418 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 OTPQ5XKR4 325 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 OR51L1Q8NGJ5 315 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 OR6K6Q8NGW6 343 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 POM121L2Q96KW2 1035 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 TVP23BQ9NYZ1 205 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 PLCE1Q9P212 2302 aa23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-204ENST00000400919 FAM183AA6NL82 134 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 BAG2O95816 211 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 GYPBP06028 91 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 PCSK6P29122 969 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 THBS4P35443 961 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 ARL9Q6T311 187 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 BCL2L14Q9BZR8 327 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 CMAHPQ9Y471 501 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 RER1O15258 196 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 CD8AP01732 235 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 HTR5AP47898 357 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 ADAM8P78325 824 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 ADIPOQQ15848 244 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 PLBD1Q6P4A8 553 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 C9orf16Q9BUW7 83 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 LHFPL6Q9Y693 200 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 DSCAMO60469 2012 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 B9A039 149 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 ANKRD65E5RJM6 399 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 CLUP10909 449 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 PTP4A1Q93096 173 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 GSX2Q9BZM3 304 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 HDHD2Q9H0R4 259 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 OR51V1Q9H2C8 321 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 MED20Q9H944 212 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 USE1Q9NZ43 259 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 ATPIF1Q9UII2 106 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 LOC100509620A0A075B734 347 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 ERICH4A6NGS2 130 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 OVOL3O00110 214 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 ALPLP05186 524 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 FAM157BP0CG42 384 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 PAX1P15863 534 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 RAD23AP54725 363 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 UCP2P55851 309 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 RAB35Q15286 201 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 SLC18B1Q6NT16 456 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 CPOQ8IVL8 374 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 C1orf174Q8IYL3 243 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 OR1F12Q8NHA8 337 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 ZNRF4Q8WWF5 429 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 PLK3Q9H4B4 646 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 RIBC2Q9H4K1 309 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 TVP23AA6NH52 213 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 ZAR1LA6NP61 321 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 EI24O14681 340 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 PRODHO43272 600 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 GGT2P36268 569 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 ALDH3A2P51648 485 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 HIST1H3AP68431 136 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 EFNB3Q15768 340 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 SLX4IPQ5VYV7 408 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 CORO6Q6QEF8 472 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 HIST2H3AQ71DI3 136 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 LINC00346Q8IVM7 164 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 CBR4Q8N4T8 237 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 EME1Q96AY2 570 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 PERPQ96FX8 193 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 HCAR1Q9BXC0 346 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 GABARAPL3Q9BY60 117 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 CXXC4Q9H2H0 198 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 ELOVL3Q9HB03 270 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 SYNGR3O43761 229 aa23.66■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 GPRIN2O60269 458 aa23.66■■□□□ 1.38
FAAP20-204ENST00000400919 GLCEO94923 617 aa23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms