RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC2A1P11166 492 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 OTX2P32243 289 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 GPNMBQ14956 572 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 VAMP3Q15836 100 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 GCNT2Q8N0V5 402 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 TCTN2Q96GX1 697 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM202A6NGA9 273 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 GCH1P30793 250 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 CRYBB2P43320 205 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 C11orf87Q6NUJ2 197 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ORAI1Q96D31 301 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC35A4Q96G79 324 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 KIRREL1Q96J84 757 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 LRFN5Q96NI6 719 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 V9GYS6 101 aa17■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 OR10D4PQ8NGN7 298 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 TSLPQ969D9 159 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF586Q9NXT0 402 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 TAF1P21675 1872 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ASPDHA6ND91 283 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 PCMT1P22061 227 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 CORO6Q6QEF8 472 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 STACQ99469 402 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 LEUTXA8MZ59 168 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 PRAMEF4O60810 478 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 CALCRP30988 508 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 HCSTQ9UBK5 93 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ANGPTL7O43827 346 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 HRH1P35367 487 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 FABP9Q0Z7S8 132 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 HIPK2Q9H2X6 1198 aa16.99■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 FCMRO60667 390 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 RAG2P55895 527 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 OR51A2Q8NGJ7 313 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 BCL2L10Q9HD36 194 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 A8MVM7 634 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 PNPP00491 289 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 TM7SF3Q9NS93 570 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 FTSJ1Q9UET6 329 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 DSCR3O14972 297 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 RPL27P61353 136 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 OR2W3Q7Z3T1 314 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 KIAA1958Q8N8K9 716 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF610Q8N9Z0 462 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 CASD1Q96PB1 797 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 OR51I2Q9H344 312 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 F6UZH7 168 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 TBPP20226 339 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 FGF7P21781 194 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 SSX1Q16384 188 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 STT3BQ8TCJ2 826 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 REEP6Q96HR9 211 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 OPA3Q9H6K4 179 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 KCNIP2Q9NS61 270 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 SRPK3Q9UPE1 567 aa16.98■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ARID1AO14497 2285 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 NTF3P20783 257 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF90Q03938 601 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 SSX7Q7RTT5 188 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 OR13D1Q8NGV5 346 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 LYSMD1Q96S90 227 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 SMIM7Q9BQ49 75 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 STRADBQ9C0K7 418 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 HSD17B6O14756 317 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 TMPRSS11DO60235 418 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ZFAND5O76080 213 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 PRR35P0CG20 571 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF250P15622 560 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 LIM2P55344 173 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 UBAC2Q8NBM4 344 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 OR4A16Q8NH70 328 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 LHX4Q969G2 390 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 TVP23CQ96ET8 276 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF251Q9BRH9 671 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 WNT1P04628 370 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 METTL15P1P0C7V9 234 aa16.97■□□□□ 0.31
AMIGO1-202ENST00000369864 FABP4P15090 132 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms