RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ZIC4Q8N9L1 334 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 SETD6Q8TBK2 473 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 SLITRK2Q9H156 845 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 G6PC2Q9NQR9 355 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 A6NL46 340 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 IFITM5A6NNB3 132 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CXCL13O43927 109 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 MAS1P04201 325 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 RFX2P48378 723 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CLDN15P56746 228 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 RIN1Q13671 783 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ZNF544Q6NX49 715 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 DEGS2Q6QHC5 323 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CADM3Q8N126 398 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 DNAAF1Q8NEP3 725 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR6N1Q8NGY5 312 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ZNF671Q8TAW3 534 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 TMEM54Q969K7 222 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ARGFXA6NJG6 315 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 RAF1P04049 648 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CD82P27701 267 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 TALDO1P37837 337 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CSNK1A1P48729 337 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 GFRA1P56159 465 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 NRARPQ7Z6K4 114 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 VASH2Q86V25 355 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 LGALS14Q8TCE9 139 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ROBO4Q8WZ75 1007 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ADGRG7Q96K78 797 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 NEDD4LQ96PU5 975 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 C1orf198Q9H425 327 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR52A1Q9UKL2 312 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 SPATA2Q9UM82 520 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 POLR1DQ9Y2S0 133 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 AIPO00170 330 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 PLA2G10O15496 165 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CELA3AP09093 270 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 SELENOPP49908 381 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CLDN12P56749 244 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ASAH1Q13510 395 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ZNF554Q86TJ5 538 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 TMEM123Q8N131 208 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 GALNT16Q8N428 558 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR2V1Q8NHB1 315 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ASCL3Q9NQ33 180 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 FREM2Q5SZK8 3169 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 FAM166BA8MTA8 275 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 DNPH1O43598 174 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 SLC43A1O75387 559 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 PITPNBP48739 271 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 KCNMB1Q16558 191 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 SGCAQ16586 387 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR10D3Q8NH80 312 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 KCNJ15Q99712 375 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 TRIQKQ629K1 86 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 UBE2J2Q8N2K1 259 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ASB5Q8WWX0 329 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ABHD1Q96SE0 405 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.132e-23■■■□□ 15.6
ACTB-201ENST00000331789 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 FAM206AQ9NX38 181 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ASH2LQ9UBL3 628 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 DHDHQ9UQ10 334 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 HLA-DQB1P01920 261 aa15.83■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 NTF4P34130 210 aa15.83■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ASPHD2Q6ICH7 369 aa15.83■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 FCRLAQ7L513 359 aa15.83■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 C19orf18Q8NEA5 215 aa15.83■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 NEURL2Q9BR09 285 aa15.83■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 WACQ9BTA9 647 aa15.83■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 TTTY12Q9BZ98 90 aa15.83■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 LIN7BQ9HAP6 207 aa15.83■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ETAA1Q9NY74 926 aa15.83■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ANXA2P2A6NMY6 339 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 P2RY10O00398 339 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 RER1O15258 196 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 HPNP05981 417 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 SP1P08047 785 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ADRB1P08588 477 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 UBE2NLQ5JXB2 153 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 C10orf128Q5T292 105 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 BCL2L15Q5TBC7 163 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 KLHL24Q6TFL4 600 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ASB18Q6ZVZ8 466 aa15.82■□□□□ 0.12
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