RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 DHRS2Q13268 280 aa15.47■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 RAB12Q6IQ22 244 aa15.47■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 TFAP2EQ6VUC0 442 aa15.47■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC6A7Q99884 636 aa15.47■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC25A12O75746 678 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 PI3P19957 117 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 NFYBP25208 207 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 CAPZA1P52907 286 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 CDNFQ49AH0 187 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 LINC00518Q8N0U6 118 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 GPBAR1Q8TDU6 330 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 GPR119Q8TDV5 335 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 ROBO4Q8WZ75 1007 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 EPOPA6NHQ4 379 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 TNFRSF10CO14798 259 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 THEGLP0DJG4 465 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 NAT2P11245 290 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 HLA-DOBP13765 273 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 AKR1C4P17516 323 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 CD34P28906 385 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 KCNJ3P48549 501 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 DNASE1L1P49184 302 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 FMODQ06828 376 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 EGR3Q06889 387 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 PRTGQ2VWP7 1150 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 GPX8Q8TED1 209 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 ASB5Q8WWX0 329 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 CENPMQ9NSP4 180 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 CYP8B1Q9UNU6 501 aa15.46■□□□□ 0.07
SEPHS1-201ENST00000327347 RFPL4AA6NLU0 287 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 SEMA4FO95754 770 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 HPP00738 406 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 IL11P20809 199 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ATP1B3P54709 279 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 DNM1P46Q6ZS02 220 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 TTLL10Q6ZVT0 673 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 OR13C3Q8NGS6 347 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM131CQ96AQ9 280 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 SPACA5Q96QH8 159 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 LDAHQ9H6V9 325 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC22A11Q9NSA0 550 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 CKLFQ9UBR5 152 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 TO15178 435 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF432O94892 652 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 TAS2R19P59542 299 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 TMPPEQ6ZT21 453 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 RLN3Q8WXF3 142 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ABHD6Q9BV23 337 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 KLK13Q9UKR3 277 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 LRP12Q9Y561 859 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 OR6C76A6NM76 312 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 DCNP07585 359 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 BAMBIQ13145 260 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 TGIF1Q15583 401 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 FNDC7Q5VTL7 733 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC18B1Q6NT16 456 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 TMEM71Q6P5X7 295 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF679Q8IYX0 411 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 POTEKPQ9BYX7 375 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 PRODH2Q9UF12 536 aa15.45■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 H0YIG0 161 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 BET1O15155 118 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ITGB2P05107 769 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 CD1CP29017 333 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ACTBP60709 375 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ACTG1P63261 375 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 CXADRP78310 365 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 PMPCAQ10713 525 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 NAXDQ8IW45 347 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 TMEM151BQ8IW70 566 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF440Q8IYI8 595 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 OR6K3Q8NGY3 331 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM186AA6NE01 2351 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 A0A1B0GV50 99 aa15.44■□□□□ 0.06
SEPHS1-201ENST00000327347 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms