RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PAPPAQ13219 1627 aa6.6□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 XKRY2A2RUG3 117 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 LIPCP11150 499 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SDHBP21912 280 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 MMP11P24347 488 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 CCL11P51671 97 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 CDC20BQ86Y33 519 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 CARFQ8N187 725 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 RLN3Q8WXF3 142 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 OPALINQ96PE5 141 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 S100A8P05109 93 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SLC2A1P11166 492 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 GNB3P16520 340 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 MAKP20794 623 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 DIO1P49895 249 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 GAB3Q8WWW8 586 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TTC9Q92623 222 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ZAR1LA6NP61 321 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ABCD4O14678 606 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 NRASP01111 189 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ABCD3P28288 659 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 THBS4P35443 961 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 AQP6Q13520 282 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 DUSP5Q16690 384 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SYT14P1Q58G82 188 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 OR2A2Q6IF42 318 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SDF2Q99470 211 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TEX101Q9BY14 249 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 DLL4Q9NR61 685 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PPT2Q9UMR5 302 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PPP1R2P9O14990 202 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 JTBO76095 146 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 HPNP05981 417 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 POU2F2P09086 479 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 RAB1AP62820 205 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 FAM53BQ14153 422 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 RNF151Q2KHN1 245 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 VHLLQ6RSH7 139 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 M1APQ8TC57 530 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 GPX8Q8TED1 209 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 CACNA1SQ13698 1873 aa6.59□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SERTM1A2A2V5 107 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CTDSP2O14595 271 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SNCGO76070 127 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OPN1LWP04000 364 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SPI1P17947 270 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SSTR2P30874 369 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 UBE2G1P62253 170 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 FAM122BQ7Z309 247 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 PIGTQ969N2 578 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 C10orf90Q96M02 699 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TEAD3Q99594 435 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.59□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ABCA3Q99758 1704 aa6.58□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.58□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ZNF195O14628 629 aa6.58□□□□□ -1.36
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