RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF101Q8IZC7 436 aa13.63□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 OR6S1Q8NH40 331 aa13.63□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ITPKCQ96DU7 683 aa13.63□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 TXNDC15Q96J42 360 aa13.63□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM38AQ9H6F2 299 aa13.63□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 FN3KRPQ9HA64 309 aa13.63□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 MSL2Q9HCI7 577 aa13.63□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 MS4A18H0YCH9 400 aa13.62□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 MGRN1O60291 552 aa13.62□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 MS4A18Q3C1V0 323 aa13.62□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 OR6N1Q8NGY5 312 aa13.62□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 SH3GL3Q99963 347 aa13.62□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 TAGLN3Q9UI15 199 aa13.62□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa13.61□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PTOV1Q86YD1 416 aa13.61□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP24Q8N264 748 aa13.61□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 TBX15Q96SF7 602 aa13.61□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa13.61□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ARL8BQ9NVJ2 186 aa13.61□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM38BQ9NVV0 291 aa13.61□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 CSMD3Q7Z407 3707 aa13.6□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 SLC22A2O15244 555 aa13.6□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 GPR32P1Q8NGA4 272 aa13.6□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A40Q8TBP6 338 aa13.6□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM43Q9BTV4 400 aa13.6□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 OR2J1Q9GZK6 312 aa13.6□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM165Q9HC07 324 aa13.6□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 C22orf46C9J442 243 aa13.59□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM178BH3BS89 294 aa13.59□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 AGKQ53H12 422 aa13.59□□□□□ -0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 DPPA2Q7Z7J5 298 aa13.59□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 C10orf67Q8IYJ2 551 aa13.59□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHA8Q96JA3 519 aa13.59□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 EPYCQ99645 322 aa13.59□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 CDADC1Q9BWV3 514 aa13.59□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 SLC19A3Q9BZV2 496 aa13.59□□□□□ -0.23
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM15Q9C019 465 aa13.59□□□□□ -0.23
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