RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 March11Q8CBH7 400 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BphlQ8R164 291 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd177Q8R2S8 817 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Coq5Q9CXI0 327 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EurlQ9D7G4 290 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem38bQ9DAV9 292 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nkx2-4Q9EQM3 354 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Popdc3Q9ES81 291 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sult1b1Q9QWG7 299 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dennd4cA6H8H2 1906 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Anapc1P53995 1944 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3952A0A0A6YXJ1 191 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrap2D3Z1Q2 207 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r49D3Z6L3 852 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r86L7N213 316 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr835Q7TRG7 311 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo4Q8CHQ0 385 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr799Q8VGI7 311 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrps14Q9CR88 128 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9D4G1 230 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dcbld1Q9D4J3 503 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lypd6bQ9D7F2 191 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chst11Q9JME2 352 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igkv6-29A0A0G2JEI6 115 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxw24E9PXM9 466 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr585E9PXW4 318 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r67G5E8C1 305 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lgals3bpQ07797 577 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Muc19Q6JHY2 733 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mmp21Q8K3F2 568 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Med30Q9CQI9 178 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Suv39h2Q9EQQ0 477 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21117A0A087WPJ9 222 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20820A0A087WPP3 222 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20937A0A087WQA3 222 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21258A0A087WQC7 222 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21095A0A087WR14 222 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20824A0A087WS97 222 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm29866A0A0A6YX04 222 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il2raP01590 268 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hoxb6P09023 224 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acyp2P56375 106 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tfap2eQ6VUP9 442 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 H2-M2Q6W9L1 343 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr137bQ8BNQ3 385 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdk5rap1Q8BTW8 588 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr157Q8C206 330 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrp11Q8CB67 483 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam199xQ8K2D0 388 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1143Q8VEU8 314 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syt17Q920M7 470 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tex12Q9CR81 123 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp18Q9WTV6 368 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm11634A0A1B0GSX1 172 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adamtsl5D3Z689 485 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppt2O35448 302 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klf9O35739 244 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MpoP11247 718 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Milr1Q3TB92 246 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pla2g7Q60963 440 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adam12Q61824 903 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Shc4Q6S5L9 626 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem106cQ80VP8 260 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Foxj3Q8BUR3 623 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acaa2Q8BWT1 397 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lmf2Q8C3X8 702 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Csnka2ipQ8CH19 720 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm48Q8K2X2 371 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kti12Q9D1R2 351 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gk2Q9WU65 554 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Greb1Q3UHK3 1954 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ItpkbB2RXC2 942 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Oosp3G5E8D7 195 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PnmtP40935 295 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adgrg5Q3V3Z3 524 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyb561a3Q6P1H1 242 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc35f2Q7TML3 375 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1500Q7TQQ3 311 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr290Q7TS13 315 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tns4Q8BZ33 696 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrg1Q91XL1 342 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tinagl1Q99JR5 466 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpinb7Q9D695 380 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Jmjd6Q9ERI5 403 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CalcrlQ9R1W5 463 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ate1Q9Z2A5 516 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rp1l1Q8CGM2 1859 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm2022A0A1Y7VLT7 144 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tox2A2A472 547 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmsb15aA2AEH9 79 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ndufaf5A2APY7 343 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AgmatA2AS89 358 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DytnA2CI98 653 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Skint8A7XV07 398 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 1700080E11RikE9Q9G1 206 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp605E9QAH2 694 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rdh19G5E8H9 318 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm16434J3QN10 205 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prdx6O08709 224 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dbil5O09035 87 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.9 ms