RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 CRLF2Q9HC73 371 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 IKZF2Q9UKS7 526 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 LHFPL6Q9Y693 200 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6C65A6NJZ3 312 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPB2A8KAH6 182 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 TGM4P49221 684 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 NCS1P62166 190 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 SPCS2Q15005 226 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPB2Q16082 182 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 P4HA3Q7Z4N8 544 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 YIPF7Q8N8F6 280 aa21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 HTRA1Q92743 480 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 GLRX2Q9NS18 164 aa21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 CD53P19397 219 aa21.95■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 AGTR1P30556 359 aa21.95■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa21.94■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 MROQ9BYG7 248 aa21.94■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 ELOVL3Q9HB03 270 aa21.94■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 PGLYRP3Q96LB9 341 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF416Q9BWM5 594 aa21.93■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM38BQ9NVV0 291 aa21.93■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 SSR3Q9UNL2 185 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR1DQ9Y2S0 133 aa21.93■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa21.92■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 FAM27BQ5VT28 67 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-215ENST00000628018 DEGS2Q6QHC5 323 aa21.92■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 NDNFQ8TB73 568 aa21.92■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF254O75437 659 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT33AO76009 404 aa21.91■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.12e-10■■■■■ 40.3
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CAPNS1-215ENST00000628018 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF585AQ6P3V2 769 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP77Q6ZQR2 320 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATC1Q76KD6 591 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10S1Q8NGN2 331 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-215ENST00000628018 SLAMF6Q96DU3 332 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXB1Q99853 325 aa21.91■■□□□ 1.1
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