RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	GYPA	P02724	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	APLNR	P35414	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	HNMT	P50135	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	SLURP1	P55000	103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	CLDN17	P56750	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	ECH1	Q13011	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	CHIT1	Q13231	466 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	XKR7	Q5GH72	579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR151	Q8TDV0	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061		M0QZK8	103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC22A2	O15244	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF208	O43345	1280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	RGS11	O94810	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	MBD3	O95983	291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	AMBP	P02760	352 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	AMY1A	P04745	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	AMY2A	P04746	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061		P0C879	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	CCNA2	P20248	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	COX7A1	P24310	79 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	LCN1	P31025	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	CXCR5	P32302	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	AQP5	P55064	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	PPP1CB	P62140	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	PHEX	P78562	749 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	PSG7	Q13046	419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	FOXE3	Q13461	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	DEFB135	Q30KP9	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	STPG2	Q8N412	459 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	MNT	Q99583	582 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	EPYC	Q99645	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	FOXB1	Q99853	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	OR2F2	O95006	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	VAMP5	O95183	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	CD74	P04233	296 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	AHCY	P23526	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	NMBR	P28336	390 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	MAPK12	P53778	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	GNB1	P62873	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR50	Q13585	617 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT31	Q15323	416 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061		Q6ZWC4	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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