RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 CLEC2AQ6UVW9 174 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 RHNO1Q9BSD3 238 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 IFT27Q9BW83 186 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 NUAK2Q9H093 628 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 VNN3Q9NY84 501 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 FKBP7Q9Y680 259 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 CDH10Q9Y6N8 788 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 DHRS12A0PJE2 317 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 GASTP01350 101 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 STOMP27105 288 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 GLB1L2Q8IW92 636 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 AKR7LQ8NHP1 331 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 CANT1Q8WVQ1 401 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 POM121L2Q96KW2 1035 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 CHID1Q9BWS9 393 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 REG4Q9BYZ8 158 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 WNT5BQ9H1J7 359 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 IL20Q9NYY1 176 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 RNF223E7ERA6 249 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 CSF3P09919 207 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 FLOT2Q14254 428 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 MICAQ29983 383 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 CLEC9AQ6UXN8 241 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 ZNF525Q8N782 197 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 BCL2L14Q9BZR8 327 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 RAB1BQ9H0U4 201 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 EMC7Q9NPA0 242 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 POMPQ9Y244 141 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 U3KQV3 271 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 GSC2O15499 205 aa21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 CRABP1P29762 137 aa21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 RAD52P43351 418 aa21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 UCP2P55851 309 aa21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 DNM1P34Q6PK57 102 aa21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 UGT2A3Q6UWM9 527 aa21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 JAZF1Q86VZ6 243 aa21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 AQP11Q8NBQ7 271 aa21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 OR52L1Q8NGH7 329 aa21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 DGCR6LQ9BY27 220 aa21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 EGLN3Q9H6Z9 239 aa21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 LOC100509620A0A075B734 347 aa21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 SYNGR3O43761 229 aa21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 CST1P01037 141 aa21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 HEXAP06865 529 aa21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 FAM157BP0CG42 384 aa21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 NOS3P29474 1203 aa21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 RIPPLY3P57055 190 aa21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 LSM6P62312 80 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 SCRN3Q0VDG4 424 aa21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 KCNMB1Q16558 191 aa21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 LEG1Q6P5S2 330 aa21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 NMNAT3Q96T66 252 aa21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 RERGLQ9H628 205 aa21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 DYNLRB1Q9NP97 96 aa21.39■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 FN1P02751 2386 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 ICMTO60725 284 aa21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 LY6HO94772 140 aa21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 LY6G6DO95868 133 aa21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 RENP00797 406 aa21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 ZNF250P15622 560 aa21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 GSTM3P21266 225 aa21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 GDI2P50395 445 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 AQP6Q13520 282 aa21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 ZNF774Q6NX45 483 aa21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 OR4K13Q8NH42 304 aa21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 FAM168AQ92567 244 aa21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 FOXN4Q96NZ1 517 aa21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 SONP18583 2426 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 NAV3Q8IVL0 2385 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 M0R233 179 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 DCTN6O00399 190 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 BHLHE40O14503 412 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 COX5BP10606 129 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 LRP11Q86VZ4 500 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 SPATA24Q86W54 205 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 C10orf105Q8TEF2 133 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 TSSK2Q96PF2 358 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 SYT3Q9BQG1 590 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 RACGAP1Q9H0H5 632 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 B9D1Q9UPM9 204 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-220ENST00000618056 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa21.37■■□□□ 1.01
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