RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612199.4

SRGAP2B-204, Transcript of SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRGAP2B, Length 7,120 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR10A2Q9H208 303 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 INIPQ9NRY2 104 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 CBLCQ9ULV8 474 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 XRCC2O43543 280 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 CTGFP29279 349 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 TCTAP57738 103 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 SLC6A18Q96N87 628 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 MS4A8Q9BY19 250 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 M0R135 149 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 SLCO2B1O94956 709 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 TNFSF15O95150 251 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 QDPRP09417 244 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 FURINP09958 794 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 CD34P28906 385 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 SULT1A2P50226 295 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR1Q1Q15612 314 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF77Q15935 545 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF799Q96GE5 643 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 CXorf58Q96LI9 332 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 HHLA2Q9UM44 414 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 ATG4BQ9Y4P1 393 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 SLC22A7Q9Y694 548 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 CACNG2Q9Y698 323 aa8.7□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 DNAJC13O75165 2243 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 POM121BA6NF01 834 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 OOEPA6NGQ2 149 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 GFRA2O00451 464 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 GASTP01350 101 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 IL2RAP01589 272 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 CMTM4Q8IZR5 234 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 SFRP2Q96HF1 295 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 MYADMQ96S97 322 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 SRRQ9GZT4 340 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 C20orf202A1L168 122 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 DBX1A6NMT0 343 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 PRR32B1ATL7 298 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 IGLV3-25P01717 112 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 CSNK1A1P48729 337 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 TAS2R20P59543 309 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 ILKQ13418 452 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 MED20Q9H944 212 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 APMAPQ9HDC9 416 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 RAB3DO95716 219 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 EMP1P54849 157 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 SPCS2Q15005 226 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 FAM219BQ5XKK7 198 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 PRR27Q6MZM9 219 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 FAM198BQ6UWH4 519 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 FZR1Q9UM11 496 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 OMGP23515 440 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 DAPP51397 102 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 PCGF3Q3KNV8 242 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 BCL7AQ4VC05 210 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 IGSF11Q5DX21 431 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 OR2G6Q5TZ20 316 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 MKXQ8IYA7 352 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 COMMD1Q8N668 190 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 GPR119Q8TDV5 335 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 TBX21Q9UL17 535 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 TRIM77I1YAP6 450 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 PIAS2O75928 621 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 CLDN1O95832 211 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 TPMTP51580 245 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 C21orf58P58505 322 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 UBE2G1P62253 170 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 CEBPEQ15744 281 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 ADIPOQQ15848 244 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 RNLSQ5VYX0 342 aa8.69□□□□□ -1.02
SRGAP2B-204ENST00000612199 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms