RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593111.1

PSME3-216, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene PSME3, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-216ENST00000593111 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.77□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TRAPPC2LH3BP13 241 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 NGFP01138 241 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 MT-ND1P03886 318 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 DEFA6Q01524 100 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 FMODQ06828 376 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ZNF154Q13106 437 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 SELPLGQ14242 412 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 LAPTM4AQ15012 233 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 MOSPD2Q8NHP6 518 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 C10orf82Q8WW14 230 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 NABP1Q96AH0 204 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TAMM41Q96BW9 452 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 SGTBQ96EQ0 304 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 IGHV2-70P01814 119 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ADH4P08319 380 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ARHGDIAP52565 204 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TAS2R41P59536 307 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TAF11Q15544 211 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 FAM27BQ5VT28 67 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TREML4Q6UXN2 200 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 SPICQ8N5J4 248 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 SLC25A28Q96A46 364 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 CGREF1Q99674 301 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 MRI1Q9BV20 369 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ANGPT2O15123 496 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 IGHMP01871 453 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 CD55P08174 381 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TNFSF4P23510 183 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 LAP3P28838 519 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 MTX3Q5HYI7 312 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ARL9Q6T311 187 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TMEM239Q8WW34 195 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 C4orf45Q96LM5 186 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 RBP7Q96R05 134 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 H3BSA7 217 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 CST2P09228 141 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 NR2C1P13056 603 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ZNF12P17014 697 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 PCGF2P35227 344 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 RBM34P42696 430 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 SLC6A9P48067 706 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 PCBD1P61457 104 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 IL13RA1P78552 427 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 PSG7Q13046 419 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 CDK5R2Q13319 367 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ZNF774Q6NX45 483 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 DPP10Q8N608 796 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 OR10A6Q8NH74 314 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 STON2Q8WXE9 905 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 RIMS3Q9UJD0 308 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-216ENST00000593111 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms