RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590220.1

PIK3C3-213, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, human

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 168 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3C3-213	ENST00000590220	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	PRR25	Q96S07	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	HERC1	Q15751	4861 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	TNC	P24821	2201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	F2RL2	O00254	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	SLC28A1	O00337	649 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	SYNGR1	O43759	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	OR10H3	O60404	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	GKN3P	P0CG01	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	GSTM3	P21266	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	CCNO	P22674	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	SLC6A1	P30531	599 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	HPCAL1	P37235	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	ARHGDIA	P52565	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	PRKAA2	P54646	552 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	NAA20	P61599	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	COPZ1	P61923	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	HSF2	Q03933	536 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	GNA13	Q14344	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	MIER2	Q8N344	545 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	MYDGF	Q969H8	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	SLC38A4	Q969I6	547 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	P2RX4	Q99571	388 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	HMGN4	O00479	90 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	PLPP3	O14495	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	DVL1	O14640	695 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	MLNR	O43193	412 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	PEX14	O75381	377 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	BGLAP	P02818	100 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	ALDOB	P05062	364 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	INHBA	P08476	426 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	PGA4	P0DJD7	388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	PGA3	P0DJD8	388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	NEFH	P12036	1026 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	RAC2	P15153	192 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	IL7R	P16871	459 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF32	P17041	273 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	TAC1	P20366	129 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	RAD23A	P54725	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	PSG4	Q00888	419 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	DR1	Q01658	176 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	PUDP	Q08623	228 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220		Q6ZS46	218 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PIK3C3-213	ENST00000590220	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms