RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 TPOP07202 933 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 STSP08842 583 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PGA4P0DJD7 388 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PGA3P0DJD8 388 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 LAP3P28838 519 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SHC1P29353 583 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PMP22Q01453 160 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 BDH1Q02338 343 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF91Q05481 1191 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 EGR3Q06889 387 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 GPR50Q13585 617 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TRAM1Q15629 374 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MESTQ5EB52 335 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC103Q8IW40 242 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SYS1Q8N2H4 156 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 GJC3Q8NFK1 279 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR52N1Q8NH53 320 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SNX33Q8WV41 574 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RORBQ92753 470 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM54Q969K7 222 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RASD2Q96D21 266 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR2M2Q96R28 347 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TRIB1Q96RU8 372 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 DDOQ99489 341 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SYT4Q9H2B2 425 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 C1orf198Q9H425 327 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 WDR76Q9H967 626 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MARCH7Q9H992 704 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SIAEQ9HAT2 523 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 GALNT8Q9NY28 637 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ACOD1A6NK06 481 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 DVL2O14641 736 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MT-ND5P03915 603 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 KRT8P05787 483 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 QDPRP09417 244 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SBK2P0C263 348 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PTNP21246 168 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MSR1P21757 451 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SLC2A5P22732 501 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CTSSP25774 331 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MPGP29372 298 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 HOXC12P31275 282 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 DCTDP32321 178 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ARR3P36575 388 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR3A2P47893 321 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ENTPD1P49961 510 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CAMK2DQ13557 499 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SLC36A2Q495M3 483 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC58Q4VC31 144 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FAM27BQ5VT28 67 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ARL9Q6T311 187 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 AHSA2Q719I0 299 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF627Q7L945 461 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms