RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589475.1

EFTUD2-213, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 200 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-213ENST00000589475 GAAP10253 952 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 MYL12AP19105 171 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 COX5AP20674 150 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 AGAP20933 346 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 BMP5P22003 454 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 CRHBPP24387 322 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 PYCR1P32322 319 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC15A1P46059 708 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ENTPD1P49961 510 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 NUDT6P53370 316 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ACTA2P62736 377 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ACTG2P63267 376 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ADAM8P78325 824 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 FMODQ06828 376 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 FAPQ12884 760 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 AQP6Q13520 282 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 KCNMB1Q16558 191 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 LINC01590Q5TEZ4 76 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 TSPO2Q5TGU0 170 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 RNLSQ5VYX0 342 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 OR7E24Q6IFN5 339 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 FDX2Q6P4F2 183 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ANKRD16Q6P6B7 361 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 VWA1Q6PCB0 445 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 LRFN4Q6PJG9 635 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 KLHL24Q6TFL4 600 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 UGT2A3Q6UWM9 527 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 PLXDC2Q6UX71 529 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 C3P1Q6ZMU1 363 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF627Q7L945 461 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC16A9Q7RTY1 509 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC35F2Q8IXU6 374 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF843Q8N446 348 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 STX19Q8N4C7 294 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 BBS1Q8NFJ9 593 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC26A10Q8NG04 563 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 OR51G2Q8NGK0 314 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 OR6N2Q8NGY6 317 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 OR2T27Q8NH04 317 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ASB17Q8WXJ9 295 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 NSMAFQ92636 917 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 FCGR1BQ92637 280 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 UBE2FQ969M7 185 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 STARD4Q96DR4 205 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 RNFT2Q96EX2 444 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 BOD1Q96IK1 185 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 TSSK2Q96PF2 358 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 COPS4Q9BT78 406 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 CDADC1Q9BWV3 514 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 JAM3Q9BX67 310 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 HCAR1Q9BXC0 346 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 HDHD5Q9BXW7 423 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 OR10A4Q9H209 315 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF696Q9H7X3 374 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 MED20Q9H944 212 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 WDR76Q9H967 626 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 OBP2BQ9NPH6 170 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 POLE4Q9NR33 117 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM38BQ9NVV0 291 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 GALNT8Q9NY28 637 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 UBAP1Q9NZ09 502 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 ATPIF1Q9UII2 106 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 SNX5Q9Y5X3 404 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 NBEAQ8NFP9 2946 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 A0A0G2JNJ9 132 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 MAGEA13PA6NCF6 341 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 A8MXE2 369 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 DCTN6O00399 190 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 MYL12BO14950 172 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 XPNPEP2O43895 674 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 UBL3O95164 117 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 WNT11O96014 354 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 PTHP01270 115 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 APOC1P02654 83 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 CDK1P06493 297 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 LYNP07948 512 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 CST2P09228 141 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 SPARCP09486 303 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 CLUP10909 449 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 B4GALT1P15291 398 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-213ENST00000589475 PPP3CBP16298 524 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms