RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588228.5

NFIX-210, Transcript of nuclear factor I X, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NFIX, Length 1,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIX-210ENST00000588228 ZNF708P17019 499 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-210ENST00000588228 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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NFIX-210ENST00000588228 NELFAQ9H3P2 528 aa14.63□□□□□ -0.07
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NFIX-210ENST00000588228 ZNF878C9JN71 531 aa14.62□□□□□ -0.07
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