RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GVT2 93 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PPC1 479 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 C9orf170A2RU37 121 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CPED1A4D0V7 1026 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS37A4D1T9 235 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 OR6C76A6NM76 312 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 TO15178 435 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF208O43345 1280 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CA11O75493 328 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 STATHP02808 62 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ITGA5P08648 1049 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CT62P0C5K7 136 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM6P0DI80 62 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 NPIPA8P0DM63 369 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CT45A8P0DMV1 189 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CT45A9P0DMV2 189 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 NR2C1P13056 603 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CXCR1P25024 350 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 VIPR2P41587 438 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB13P51153 203 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 BLKP51451 505 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 MMP16P51512 607 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CLDN12P56749 244 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB5BP61020 215 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 IL13RA1P78552 427 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PMPCAQ10713 525 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ZP4Q12836 540 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 GRM7Q14831 915 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CSRP2Q16527 193 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PCK2Q16822 640 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF212Q495C1 297 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CDNFQ49AH0 187 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR38Q5JTN6 314 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF511Q8NB15 262 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF563Q8TA94 476 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM234Q8WY98 164 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 FGF13Q92913 245 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC25A28Q96A46 364 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 KXD1Q9BQD3 176 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 NUDT9Q9BW91 350 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PBX4Q9BYU1 374 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 GMEB2Q9UKD1 530 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF98A6NK75 572 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 DBX1A6NMT0 343 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 A8MVM7 634 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SULT2B1O00204 365 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 RFXAPO00287 272 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GNB5O14775 395 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 LATO43561 262 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXS1O43638 330 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 STK17BO94768 372 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 AKR7A3O95154 331 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV1D-16P01601 117 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CRHP06850 196 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF735P0CB33 412 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 NAT2P11245 290 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CD79AP11912 226 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GP1BBP13224 206 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ICAM2P13598 275 aa6.96□□□□□ -1.3
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