RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559		F5H5P2	479 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CD3D	P04234	171 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ISG15	P05161	165 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ENPP1	P22413	925 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	S100A11	P31949	105 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	NXPH1	P58417	271 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	GUCA2A	Q02747	115 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ETFDH	Q16134	617 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	EXO5	Q9H790	373 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		16.54	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	RAD1	O60671	282 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	GABRA1	P14867	456 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ACHE	P22303	614 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	DNASE1L1	P49184	302 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ZP4	Q12836	540 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	COL19A1	Q14993	1142 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM205	Q6UW68	189 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	BIVM	Q86UB2	503 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ST8SIA1	Q92185	356 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PTX4	Q96A99	478 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MED11	Q9P086	117 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	16.53	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	RP2	O75695	350 aa		16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PMS2P2	O95744	297 aa		16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	TDG	Q13569	410 aa		16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	KMT5C	Q86Y97	462 aa		16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		16.52	■□□□□ 0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SDC3	O75056	442 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	WISP1	O95388	367 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ITGB2	P05107	769 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SRF	P11831	508 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	FOLR1	P15328	257 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	H2BFS	P57053	126 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MELK	Q14680	651 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	C4orf46	Q504U0	113 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	OTP	Q5XKR4	325 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SEH1L	Q96EE3	360 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf198	Q9H425	327 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	RDH8	Q9NYR8	311 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		16.52	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	FREM3	P0C091	2139 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	AQP8	O94778	261 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	RAB3D	O95716	219 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	HRG	P04196	525 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	PTGS2	P35354	604 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	PCK2	Q16822	640 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	TSSK4	Q6SA08	328 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF627	Q7L945	461 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	NAXD	Q8IW45	347 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	OR8S1	Q8NH09	359 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MED9	Q9NWA0	146 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	GOSR2	O14653	212 aa		16.51	■□□□□ 0.23
RRN3-205	ENST00000563559	ARPC5	O15511	151 aa		16.51	■□□□□ 0.23

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