RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 OR6X1Q8NH79 312 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 TMEM106AQ96A25 262 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 LDAHQ9H6V9 325 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 DOCK7Q96N67 2140 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 FABP12A6NFH5 140 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 FAM25AB3EWG3 89 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 FAM25CB3EWG5 89 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 FAM25GB3EWG6 89 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 SERPINA3P01011 423 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 MAS1P04201 325 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 CD46P15529 392 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 SRMP19623 302 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 RAB3BP20337 219 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 LAP3P28838 519 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 OR52N5Q8NH56 324 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 MAP6Q96JE9 813 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 SNX18Q96RF0 628 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 MED18Q9BUE0 208 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 GLTPQ9NZD2 209 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 TPRP12270 2363 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 ZNF879B4DU55 563 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 PIN1P1O15428 100 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 KLK10O43240 276 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 SC5DO75845 299 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 ARL6IP5O75915 188 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 H2BFMP0C1H6 154 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 CD40LGP29965 261 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 NTF4P34130 210 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 CAPZA2P47755 286 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 MTNR1BP49286 362 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 CLDN12P56749 244 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 ZNF45Q02386 682 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 TRAM1Q15629 374 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 TRIM16LQ309B1 348 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 ZNF766Q5HY98 468 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 CCDC190Q86UF4 302 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 ATF6BQ99941 703 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 SH3GL3Q99963 347 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 PHYHO14832 338 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 GAAP10253 952 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 GFRA1P56159 465 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 FOXC1Q12948 553 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 TAF13Q15543 124 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 TAB1Q15750 504 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 HES5Q5TA89 166 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 STEAP3Q658P3 488 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 CFAP77Q6ZQR2 320 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 POC5Q8NA72 575 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 NTNG2Q96CW9 530 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 DERL3Q96Q80 235 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 OR2M2Q96R28 347 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 FANCFQ9NPI8 374 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.46□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.46□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 GPRIN2O60269 458 aa7.46□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 VAMP5O95183 116 aa7.46□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 CD53P19397 219 aa7.46□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 PTGS2P35354 604 aa7.46□□□□□ -1.21
CS-215ENST00000549143 KIR3DL2P43630 455 aa7.46□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms