RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 BMPERQ8N8U9 685 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 ELOA3Q8NG57 546 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 OR51A7Q8NH64 312 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 POC1BQ8TC44 478 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 RAB24Q969Q5 203 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 SLC25A46Q96AG3 418 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 LOXL4Q96JB6 756 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 ASPNQ9BXN1 380 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 CMC2Q9NRP2 79 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 NLKQ9UBE8 527 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 ZNF222Q9UK12 451 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-204ENST00000546621 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 TMEM129A0AVI4 362 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 RIIAD1A6NNX1 92 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 LGALS8O00214 317 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 SOCS6O14544 535 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 ITGB1BP1O14713 200 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 IMPA2O14732 288 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 MED6O75586 246 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 RP2O75695 350 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 NDUFB2O95178 105 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 PPP1R3DO95685 299 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 SERPINA3P01011 423 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 IGHV2-5P01817 119 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 OPN1LWP04000 364 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 MST1P26927 711 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 SDC2P34741 201 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 GNG10P50151 68 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 RAB5CP51148 216 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 WNT4P56705 351 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 NRG3P56975 720 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 PKIAP61925 76 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 NHLH2Q02577 135 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 FHL1Q13642 323 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 SSX1Q16384 188 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 PLA1AQ53H76 456 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 NIPAL3Q6P499 406 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 TMEM205Q6UW68 189 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 MARCH3Q86UD3 253 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 ZNF563Q8TA94 476 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 NUBPLQ8TB37 319 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 DTD1Q8TEA8 209 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 LPAR4Q99677 370 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 MESP1Q9BRJ9 268 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 OR51J1Q9H342 316 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 PISDQ9UG56 409 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 BTBD17A6NE02 478 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 FAM183AA6NL82 134 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 DISC1C4P0D8 188 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 LRRN3E7EW58 273 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 E9PI62 339 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 FLRT2O43155 660 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 HCRTR2O43614 444 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 FADS1O60427 444 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 IGHA1P01876 353 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-204ENST00000546621 OR4E1P0C645 316 aa7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms