RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 C22orf42Q6IC83 251 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TCEAL6Q6IPX3 200 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 C16orf87Q6PH81 154 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SSX6Q7RTT6 188 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CENPSQ8N2Z9 138 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SDR9C7Q8NEX9 313 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 OR5L2Q8NGL0 311 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ELP5Q8TE02 316 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 METTL21AQ8WXB1 218 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 UFD1Q92890 307 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TCEAL3Q969E4 200 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 C8orf44Q96CB5 159 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 NTNG2Q96CW9 530 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 RASD2Q96D21 266 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 IMMP1LQ96LU5 166 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 Q96M85 177 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 LRFN5Q96NI6 719 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 NMNAT3Q96T66 252 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TBX5Q99593 518 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 LPAR4Q99677 370 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 KCNS3Q9BQ31 491 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 MED18Q9BUE0 208 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 HDHD5Q9BXW7 423 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 HMG20AQ9NP66 347 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 INPP5EQ9NRR6 644 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 TAS2R10Q9NYW0 307 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 COPS3Q9UNS2 423 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 SLC6A5Q9Y345 797 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 PEX16Q9Y5Y5 336 aa4.84□□□□□ -1.63
TRDN-205ENST00000546248 XIRP2A4UGR9 3374 aa4.84□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 REV3LO60673 3130 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ANKUB1A6NFN9 424 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 B4E171 279 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 J3QLW9 94 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 GABRPO00591 440 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SLC30A4O14863 429 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 OGG1O15527 345 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 RNF13O43567 381 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 PLPP2O43688 288 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ZFAND5O76080 213 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 GLCEO94923 617 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 IL1AP01583 271 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 GP1BAP07359 652 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 OR2T7P0C7T2 308 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ZNF883P0CG24 379 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 LYL1P12980 280 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ZNF19P17023 458 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ZNF3P17036 446 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 CD53P19397 219 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 CELP19835 753 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 IL11P20809 199 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 GALP22466 123 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 CXCR1P25024 350 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 AVPR2P30518 371 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 TNFSF8P32971 234 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SDC2P34741 201 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 EVI2BP34910 448 aa4.83□□□□□ -1.64
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TRDN-205ENST00000546248 RPS5P46782 204 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 RORCP51449 518 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 SLC25A1P53007 311 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 C17orf67Q0P5P2 114 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 GGTLC2Q14390 218 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 INSL4Q14641 139 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 OXA1LQ15070 435 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 PON3Q15166 354 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ANGPT1Q15389 498 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 CDONQ4KMG0 1287 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ALG10Q5BKT4 473 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 ZNF684Q5T5D7 378 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 OR5M10Q6IEU7 315 aa4.83□□□□□ -1.64
TRDN-205ENST00000546248 LEG1Q6P5S2 330 aa4.83□□□□□ -1.64
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