RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531857.1

PKP3-208, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 4

Gene PKP3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-208ENST00000531857 KRT73Q86Y46 540 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 FAM162AQ96A26 154 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 RNF121Q9H920 327 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 DHHO43323 396 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 MT-ATP6P00846 226 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 FSHBP01225 129 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 IFNA14P01570 189 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 ERFP50548 548 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 GZMMP51124 257 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 UCP2P55851 309 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 TEKQ02763 1124 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 ZP4Q12836 540 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 LRTOMTQ8WZ04 291 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 ZNF566Q969W8 418 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 RDH12Q96NR8 316 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 ZNF747Q9BV97 191 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 DECR2Q9NUI1 292 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 SCOCQ9UIL1 159 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-208ENST00000531857 CLDN25C9JDP6 229 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 M0R3H8 397 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 PRSS23O95084 383 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 OR6A2O95222 327 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SNAP29O95721 258 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 CH25HO95992 272 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 QDPRP09417 244 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 PGA4P0DJD7 388 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 PGA3P0DJD8 388 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 MAKP20794 623 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 LCN2P80188 198 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SCARB2Q14108 478 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 TBC1D28Q2M2D7 210 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 VMACQ2NL98 169 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 HFEQ30201 348 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 MCHR1Q99705 422 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 CHID1Q9BWS9 393 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 RNF13O43567 381 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 THY1P04216 161 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 BLMHQ13867 455 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SELPLGQ14242 412 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 GK3PQ14409 553 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 NPTX1Q15818 432 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ZNF74Q16587 644 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SLC36A2Q495M3 483 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SMYD1Q8NB12 490 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 RAB1CQ92928 201 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ZNF607Q96SK3 696 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SLC13A4Q9UKG4 626 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SPRY3O43610 288 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 CHP2O43745 196 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SERPINB7O75635 380 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 TIPRLO75663 272 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 MFN2O95140 757 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 LYPD3O95274 346 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 IGHV1-46P01743 117 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 IGHV3-13P01766 116 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 HKR1P10072 659 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ZNF81P51508 661 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 AQP4P55087 323 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ZNF613Q6PF04 617 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 LRRC18Q8N456 261 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 CCL17Q92583 94 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 TIMD4Q96H15 378 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 PYURFQ96I23 114 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 DUX5Q96PT3 197 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ZNF347Q96SE7 839 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms