RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531041.1

SF3B2-211, Transcript of splicing factor 3b subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SF3B2, Length 1,440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SF3B2-211ENST00000531041 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.75□□□□□ -0.05
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SF3B2-211ENST00000531041 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.75□□□□□ -0.05
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SF3B2-211ENST00000531041 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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SF3B2-211ENST00000531041 PSG4Q00888 419 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B2-211ENST00000531041 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B2-211ENST00000531041 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SF3B2-211ENST00000531041 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.74□□□□□ -0.05
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SF3B2-211ENST00000531041 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B2-211ENST00000531041 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B2-211ENST00000531041 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SF3B2-211ENST00000531041 GJC3Q8NFK1 279 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B2-211ENST00000531041 APH1BQ8WW43 257 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B2-211ENST00000531041 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B2-211ENST00000531041 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B2-211ENST00000531041 PTPN13Q12923 2485 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B2-211ENST00000531041 SERPINA5P05154 406 aa14.73□□□□□ -0.05
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