RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MXRA5Q9NR99 2828 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRSS37A4D1T9 235 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 B4DSR2 109 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H3BSA7 217 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COX5BP10606 129 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSD17B1P14061 328 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TUBG1P23258 451 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IL2RGP31785 369 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LIPAP38571 399 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAGEB1P43366 347 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGDIAP52565 204 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCL8P80075 99 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ALKBH6Q3KRA9 238 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FGD3Q5JSP0 725 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM209AQ5JX71 171 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM122BQ7Z309 247 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF101Q8IZC7 436 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 YIPF5Q969M3 257 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 Q96M85 177 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF570Q96NI8 536 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RACGAP1Q9H0H5 632 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NRIP3Q9NQ35 241 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TUBG2Q9NRH3 451 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYSLTR2Q9NS75 346 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DECR2Q9NUI1 292 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AURKCQ9UQB9 309 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLSCR5A0PG75 271 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPIHO43447 177 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RP2O75695 350 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCR1O76036 304 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TFP02787 698 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SDHAP31040 664 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WNT5AP41221 380 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRYBB2P43320 205 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OMPP47874 163 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LIMS1P48059 325 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF81P51508 661 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCRN3Q0VDG4 424 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CR1LQ2VPA4 569 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPATS1Q496A3 300 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MESTQ5EB52 335 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF774Q6NX45 483 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADCK1Q86TW2 530 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PGAM4Q8N0Y7 254 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF148Q8N7C7 305 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PYURFQ96I23 114 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DHRS1Q96LJ7 313 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C4orf45Q96LM5 186 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC37BQ96QE4 947 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDE1Q9NXR1 346 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UNC119BA6NIH7 251 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H7C1C5 153 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPS6KA3P51812 740 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1CBP62140 327 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCN6P62502 163 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCNIQ14094 377 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZMAT1Q5H9K5 638 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZER1Q7Z7L7 766 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GLB1L2Q8IW92 636 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM86B1Q8N7N1 296 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLDND2Q8NHS1 167 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABHD4Q8TB40 342 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC25A40Q8TBP6 338 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MCUR1Q96AQ8 359 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DIRC2Q96SL1 478 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2J1Q9GZK6 312 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TBCCD1Q9NVR7 557 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TAGLN3Q9UI15 199 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC16A7O60669 478 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDC14BO60729 498 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCTN3O75935 186 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TXNDC12O95881 172 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCG5P05408 212 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADH4P08319 380 aa12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms