RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498801.5

GARNL3-222, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-222ENST00000498801 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 PMPCAQ10713 525 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 ZP4Q12836 540 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 COX10Q12887 443 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 RIPK1Q13546 671 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 SLC17A1Q14916 467 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 TAF11Q15544 211 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 TRIP10Q15642 601 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 ZBED5Q49AG3 693 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 ALG10Q5BKT4 473 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 KDM8Q8N371 416 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 CBR4Q8N4T8 237 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 EME1Q96AY2 570 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 OXGR1Q96P68 337 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 PRR25Q96S07 402 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 UCK2Q9BZX2 261 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 PIGMQ9H3S5 423 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 INIPQ9NRY2 104 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 EMC3Q9P0I2 261 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF724A8MTY0 619 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 MCIDASD6RGH6 385 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 GPR171O14626 319 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 EI24O14681 340 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 SERPINI2O75830 405 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 NDUFB2O95178 105 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 SOX14O95416 240 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 ATP6V1G2O95670 118 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 CGAP01215 116 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 YES1P07947 543 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 HLA-DOBP13765 273 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 AGTR1P30556 359 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 PEX19P40855 299 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 DAPP51397 102 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 FXYD6P3P58550 94 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 SORDQ00796 357 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 SLC34A1Q06495 639 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 FOXF2Q12947 444 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 RFX4Q33E94 735 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 LPCAT4Q643R3 524 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 PXKQ7Z7A4 578 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 UEVLDQ8IX04 471 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 PARP8Q8N3A8 854 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 OR52D1Q9H346 318 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 KRT84Q9NSB2 600 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 USE1Q9NZ43 259 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-222ENST00000498801 DOCK7Q96N67 2140 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms