RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 RFXANKO14593 260 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 TYROBPO43914 113 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 TSPAN9O75954 239 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 KRT34O76011 436 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 ZNF205O95201 554 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 ABHD16AO95870 558 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 IGHV1-69P01742 117 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 HIST1H2ABP04908 130 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 LIPFP07098 398 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 VIMP08670 466 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 THRBP10828 461 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 ETFAP13804 333 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 IRF2P14316 349 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 EPHA3P29320 983 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 ALDH3A1P30838 453 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 CFHR2P36980 270 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 WNT5AP41221 380 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 MMP16P51512 607 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 CDK5R2Q13319 367 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 MELKQ14680 651 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 KLHL22Q53GT1 634 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 SPRNQ5BIV9 151 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 AGBL2Q5U5Z8 902 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 CD276Q5ZPR3 534 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 FAM91A1Q658Y4 838 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 C11orf88Q6PI97 169 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 WDR88Q6ZMY6 472 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 NUDCD3Q8IVD9 361 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 LSMEM1Q8N8F7 131 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 NPEPL1Q8NDH3 523 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 TCP10LQ8TDR4 215 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 SLC38A5Q8WUX1 472 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 HIST1H2ACQ93077 130 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 LHX4Q969G2 390 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 TMEM19Q96HH6 336 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 OR52E6Q96RD3 313 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 SIGLEC11Q96RL6 698 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 ZBTB18Q99592 522 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 OCSTAMPQ9BR26 566 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 TOR3AQ9H497 397 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 VPREB3Q9UKI3 123 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 USH1CQ9Y6N9 552 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 A0A0U1RQK1 487 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PRG6 482 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 GMNCA6NCL1 334 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 ZNF879B4DU55 563 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 SASH3O75995 380 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 PAHP00439 452 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 FBP1P09467 338 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 PGA4P0DJD7 388 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 PGA3P0DJD8 388 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 UMPSP11172 480 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 NR2C1P13056 603 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 ZNF32P17041 273 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 TUBG1P23258 451 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 HTR2AP28223 471 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 CDKN2CP42773 168 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 SRP9P49458 86 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 NPY4RP50391 375 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 NME5P56597 212 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 ERVK-25P63136 954 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 GUCY1A3Q02108 690 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 PSG7Q13046 419 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 KCNJ8Q15842 424 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 ZNF404Q494X3 552 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 RUNDC3AQ59EK9 446 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 TMEM255AQ5JRV8 349 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 NOXO1Q8NFA2 376 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 OR4F17Q8NGA8 305 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 AKR7LQ8NHP1 331 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 BBS10Q8TAM1 723 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 MCHR2Q969V1 340 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 TLCD1Q96CP7 247 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1-205ENST00000495350 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms