RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490432.1

TAF1B-208, Transcript of TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B, human

TSL 3

Gene TAF1B, Length 620 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1B-208	ENST00000490432	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	FAM168A	Q92567	244 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	SAMD8	Q96LT4	415 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	TSSK2	Q96PF2	358 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	THTPA	Q9BU02	230 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	NUAK2	Q9H093	628 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	RNF121	Q9H920	327 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	CDH20	Q9HBT6	801 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	IL20	Q9NYY1	176 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	OR6C6	A6NF89	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	AQP12B	A6NM10	295 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432		M0R233	179 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	NDUFS8	O00217	210 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	TNFRSF11B	O00300	401 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	XKRY	O14609	159 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	CD5L	O43866	347 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	SLC16A7	O60669	478 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	NCR1	O76036	304 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	MPZL1	O95297	269 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	CLPTM1	O96005	669 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	GAST	P01350	101 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	RAP2A	P10114	183 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	SLC6A6	P31641	620 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	ALDH3B1	P43353	468 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	NR4A2	P43354	598 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	PCBD1	P61457	104 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	GALK2	Q01415	458 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	HSF2	Q03933	536 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	BNIP1	Q12981	228 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	AQP6	Q13520	282 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	RIN1	Q13671	783 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	GK3P	Q14409	553 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	OTP	Q5XKR4	325 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	ZNF774	Q6NX45	483 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	OR6V1	Q8N148	313 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	LINC00471	Q8N535	108 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	OR2T29	Q8NH02	315 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	FZR1	Q9UM11	496 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	OR6C68	A6NDL8	312 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	INAFM1	C9JVW0	142 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432		H3BSA7	217 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	IDH3B	O43837	385 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	RP2	O75695	350 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	STAMBP	O95630	424 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	GPANK1	O95872	356 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	IGHV3-13	P01766	116 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	ADRA2A	P08913	450 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	PSKH1	P11801	424 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	APLNR	P35414	380 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	IFNGR2	P38484	337 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	PDLIM4	P50479	330 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	PLP2	Q04941	152 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	MICA	Q29983	383 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TAF1B-208	ENST00000490432	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71

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