RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488550.5

MEIS1-209, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS1, Length 5,111 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-209ENST00000488550 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 FAM3CQ92520 227 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 HGDQ93099 445 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 MS4A10Q96PG2 267 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 FKRPQ9H9S5 495 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 CMC2Q9NRP2 79 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 NDUFB6O95139 128 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 ICAM2P13598 275 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 PIGCQ92535 297 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 SMIM19Q96E16 107 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 EGLN2Q96KS0 407 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 IL17FQ96PD4 163 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 RNF2Q99496 336 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 CHST6Q9GZX3 395 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 CA14Q9ULX7 337 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 VDAC3Q9Y277 283 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.94□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 NTF3P20783 257 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 BIDP55957 195 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 NSDHLQ15738 373 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 PRR18Q8N4B5 295 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 OR10C1Q96KK4 312 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 LRRC37A3O60309 1634 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 OR5H15A6NDH6 313 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 OR5H1A6NKK0 313 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 IFITM5A6NNB3 132 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 HSBP1O75506 76 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 AMTP48728 403 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 ATP6V1FQ16864 119 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 BVESQ8NE79 360 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 GPR87Q9BY21 358 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 A6NIN4 97 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 LEUTXA8MZ59 168 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 FZD9O00144 591 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 MBTPS2O43462 519 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF217O75362 1048 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 CHRM4P08173 479 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 GPR12P47775 334 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 IL13RA2Q14627 380 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 SYPL1Q16563 259 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 Q1RN00 199 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 SCAMP4Q969E2 229 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 FAM210BQ96KR6 192 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 GPR78Q96P69 363 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 NAT8Q9UHE5 227 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 H0Y8G0 127 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 SOCS6O14544 535 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 PLSCR1O15162 318 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 SEMA7AO75326 666 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 CD79AP11912 226 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 MMP11P24347 488 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 HTR5AP47898 357 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 COL19A1Q14993 1142 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 MMP21Q8N119 569 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 GJC3Q8NFK1 279 aa6.93□□□□□ -1.3
MEIS1-209ENST00000488550 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms