RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	HTRA1	Q92743	480 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	FBXO17	Q96EF6	278 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARL5B	Q96KC2	179 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPCS	Q9HAB8	311 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	POLE3	Q9NRF9	147 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	EXD2	Q9NVH0	621 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	MKLN1	Q9UL63	735 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	FKBP7	Q9Y680	259 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941		A0A0G2JPF8	293 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941		B9A039	149 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAAH	O00519	579 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TCF21	O43680	179 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIAA0513	O60268	411 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCN2B	O60939	215 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PEX11A	O75192	247 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PDE5A	O76074	875 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GAGE7	O76087	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	LY6H	O94772	140 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	IL1A	P01583	271 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CHRNG	P07510	517 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TACSTD2	P09758	323 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GAGE12F	P0CL80	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GAGE12G	P0CL81	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GAGE12I	P0CL82	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GIF	P27352	417 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	RYK	P34925	604 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SERPINB5	P36952	375 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CLDN8	P56748	225 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR2B6	P58173	313 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCNJ10	P78508	379 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	EMX2	Q04743	252 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	RUNX1T1	Q06455	604 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GAGE1	Q13065	139 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	GAGE4	Q13068	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC17A1	Q14916	467 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PCLAF	Q15004	111 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAPK14	Q16539	360 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SMU1	Q2TAY7	513 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	XKR7	Q5GH72	579 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	IL23R	Q5VWK5	629 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	EMB	Q6PCB8	327 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	CASP12	Q6UXS9	341 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	SHF	Q7M4L6	423 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	AAED1	Q7RTV5	226 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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