RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MOK	Q9UQ07	419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TRIM64B	A6NI03	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792		A6NIZ1	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792		M0R1B8	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	BHLHE40	O14503	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GPRIN2	O60269	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SERPINI2	O75830	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	UBL3	O95164	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NDUFB2	O95178	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GADD45G	O95257	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HLA-H	P01893	362 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CRYAA	P02489	173 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CST2	P09228	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RAP2A	P10114	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF250	P15622	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CTLA4	P16410	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NPR2	P20594	1047 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SDHA	P31040	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RRM2	P31350	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CDA	P32320	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GLRX	P35754	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CDKN1A	P38936	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CDH11	P55287	796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CTXN1	P60606	82 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RAP1B	P61224	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RAP1A	P62834	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PCK2	Q16822	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MUC15	Q8N387	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	LNX2	Q8N448	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR2T29	Q8NH02	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RASD2	Q96D21	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792		Q96M85	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NTN4	Q9HB63	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CA10	Q9NS85	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	POMP	Q9Y244	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ATR	Q13535	2644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792		B9A039	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792		E9PQ18	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SMPD2	O60906	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ENTPD5	O75356	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GMNN	O75496	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ATP5H	O75947	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	KRT33A	O76009	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GAST	P01350	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GAA	P10253	952 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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