RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460731.5

PTPN12-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 2

Gene PTPN12, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-209	ENST00000460731	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	FN3K	Q9H479	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	MED29	Q9NX70	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	GLTP	Q9NZD2	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF726	A6NNF4	738 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731		H0YHG0	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	DCTN6	O00399	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	DHH	O43323	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ZG16	O60844	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC43A1	O75387	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	UPK3A	O75631	287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SNAP29	O95721	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	IGHG1	P01857	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	HRG	P04196	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ITGA5	P08648	1049 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NR2C1	P13056	603 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC2A5	P22732	501 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PAX7	P23759	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	MPG	P29372	298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	GGT2	P36268	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CENPA	P49450	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	BID	P55957	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ISL1	P61371	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SORD	Q00796	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	IL18R1	Q13478	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	KEAP1	Q14145	624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SSX8	Q7RTT4	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RBP7	Q96R05	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TACC2	O95359	2948 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms