RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 SYT14Q8NB59 555 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 AQP11Q8NBQ7 271 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 NOXO1Q8NFA2 376 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 OR4K5Q8NGD3 323 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 OR6X1Q8NH79 312 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SLC7A13Q8TCU3 470 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 UBASH3BQ8TF42 649 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 LRR1Q96L50 414 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SNX18Q96RF0 628 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SLC29A1Q99808 456 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 FUZQ9BT04 418 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 VCXQ9H320 206 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 GLTPQ9NZD2 209 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 TRIM77I1YAP6 450 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 LILRA1O75019 489 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 IGF2P01344 180 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 CECR9P0C854 216 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 PGA4P0DJD7 388 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 PGA3P0DJD8 388 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ARR3P36575 388 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 RPL4P36578 427 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 CTXN1P60606 82 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 PRKCDQ05655 676 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 PIGFQ07326 219 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 CD47Q08722 323 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 HDDC2Q7Z4H3 204 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 MDP1Q86V88 176 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 LINC00471Q8N535 108 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ASB10Q8WXI3 467 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 FEVQ99581 238 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 FOXB1Q99853 325 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 OSBPL10Q9BXB5 764 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 NDEL1Q9GZM8 345 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 NELFAQ9H3P2 528 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 MS4A5Q9H3V2 200 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SPEF1Q9Y4P9 236 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ARRDC5A6NEK1 342 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 KCNAB3O43448 404 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 IGKV3-15P01624 115 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 IGLV1-44P01699 117 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 HLA-HP01893 362 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 TFP02787 698 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 CELA3BP08861 270 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 QDPRP09417 244 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ANXA8P13928 327 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ACADSP16219 412 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 IFNGR2P38484 337 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZNF84P51523 738 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ALDH3A2P51648 485 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 PGBD2Q6P3X8 592 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 IZUMO2Q6UXV1 221 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 NHLRC1Q6VVB1 395 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 USP43Q70EL4 1123 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 PACRGLQ8N7B6 248 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 FAM216AQ8WUB2 273 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 LIPHQ8WWY8 451 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 NSMAFQ92636 917 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 TMEM54Q969K7 222 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SOX7Q9BT81 388 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SEC61A2Q9H9S3 476 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZNF556Q9HAH1 456 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 C8orf4Q9NR00 106 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 KRT84Q9NSB2 600 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 USE1Q9NZ43 259 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 TMEM5Q9Y2B1 443 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 HIF3AQ9Y2N7 669 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 HTR3EA5X5Y0 456 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 FAM157AC9JC47 383 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 CDC42EP2O14613 210 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 DHHO43323 396 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 TRMUO75648 421 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 FARS2O95363 451 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SLC2A10O95528 541 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 RAB36O95755 333 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 GASTP01350 101 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ALPLP05186 524 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 CBR1P16152 277 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 OMPP47874 163 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SLC9A3P48764 834 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 EVX1P49640 407 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 DAPP51397 102 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 AQP4P55087 323 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 RPS23P62266 143 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ERVK-25P63136 954 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 FMODQ06828 376 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 RIN1Q13671 783 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms