RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 MPV17P39210 176 aa17.83■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 GLO1Q04760 184 aa17.83■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 TSTQ16762 297 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 ZMAT1Q5H9K5 638 aa17.83■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 CBLL1Q75N03 491 aa17.83■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 VTCN1Q7Z7D3 282 aa17.83■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 OR2J1Q9GZK6 312 aa17.83■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD19PQ9H560 264 aa17.83■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 J3KTA2 159 aa17.82■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 SPATA46Q5T0L3 261 aa17.82■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa17.82■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 USP43Q70EL4 1123 aa17.82■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD4Q8TB40 342 aa17.82■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 EGLN1Q9GZT9 426 aa17.82■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 POLE4Q9NR33 117 aa17.82■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 TUBG2Q9NRH3 451 aa17.82■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 ARMCX1Q9P291 453 aa17.82■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0G2JMP0 313 aa17.81■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa17.81■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 J3QLI3 93 aa17.81■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 CXCR6O00574 342 aa17.81■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 MPZL1O95297 269 aa17.81■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 YAP1P46937 504 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGDIAP52565 204 aa17.81■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 LIPEQ05469 1076 aa17.81■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 OR4M2Q8NGB6 313 aa17.81■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 OR13C2Q8NGS9 318 aa17.81■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 C4orf45Q96LM5 186 aa17.81■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 OCEL1Q9H607 264 aa17.81■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 PLPP2O43688 288 aa17.8■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 VENTXO95231 258 aa17.8■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 NGFP01138 241 aa17.8■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 GATA3P23771 443 aa17.8■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 SCRN3Q0VDG4 424 aa17.8■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP17.8■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF730Q6ZMV8 503 aa17.8■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 FAM122BQ7Z309 247 aa17.8■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 ZER1Q7Z7L7 766 aa17.8■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 NPEPL1Q8NDH3 523 aa17.8■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 FAHD2AQ96GK7 314 aa17.8■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 ZBED5Q49AG3 693 aa17.79■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 C1QL2Q7Z5L3 287 aa17.79■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 HSH2DQ96JZ2 352 aa17.79■□□□□ 0.44
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LIMS1-208ENST00000428064 NDEL1Q9GZM8 345 aa17.79■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa17.78■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 AVPP01185 164 aa17.78■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 SCG5P05408 212 aa17.78■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 COX4I1P13073 169 aa17.78■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
LIMS1-208ENST00000428064 GSTM3P21266 225 aa17.78■□□□□ 0.44
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