RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 C5orf34Q96MH7 638 aa8.97□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 DERL3Q96Q80 235 aa8.97□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 KCNK17Q96T54 332 aa8.97□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.97□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.97□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.97□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.97□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 EXTL2Q9UBQ6 330 aa8.97□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 IKZF2Q9UKS7 526 aa8.97□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SPATA2Q9UM82 520 aa8.97□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 VDAC3Q9Y277 283 aa8.97□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SMIM30A4D0T7 59 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 C2orf72A6NCS6 295 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TVP23AA6NH52 213 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 AIPO00170 330 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 GPR171O14626 319 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 PMS2P2O95744 297 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CALCBP10092 127 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 IFNGR1P15260 489 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF17P17021 662 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 DCTDP32321 178 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 INPP1P49441 399 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MYBPHQ13203 477 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RHOUQ7L0Q8 258 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RAB43Q86YS6 212 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 UEVLDQ8IX04 471 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM156Q8N614 296 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OXGR1Q96P68 337 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OR14A2Q96R54 314 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 GPR87Q9BY21 358 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SPRY4Q9C004 299 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 NOX4Q9NPH5 578 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TCFL5Q9UL49 500 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 V9GY05 133 aa8.96□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 GJE1A6NN92 205 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 IFITM5A6NNB3 132 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 PRR32B1ATL7 298 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CDK2AP1O14519 115 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 DVL2O14641 736 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CTDSPLO15194 276 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 DNPH1O43598 174 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 EFNA2O43921 213 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CBR3O75828 277 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 UBL3O95164 117 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 VAMP5O95183 116 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CTLA4P16410 223 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CFPP27918 469 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RIDAP52758 137 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ADAM8P78325 824 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MEP1BQ16820 701 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 BICRALQ6AI39 1079 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 KRT77Q7Z794 578 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RDH10Q8IZV5 341 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OR6X1Q8NH79 312 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RNF31Q96EP0 1072 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 C4orf45Q96LM5 186 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 HPF1Q9NWY4 346 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms