RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM221BA6H8Z2 402 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 A6NJ64 397 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ALG1L2C9J202 215 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CRHP06850 196 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PPICP45877 212 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NAAAQ02083 359 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TDGQ13569 410 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PLAC9Q5JTB6 97 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf40Q8IXQ3 194 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 COX18Q8N8Q8 333 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP19Q8WTR2 217 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD6Q9BV23 337 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 S1PR5Q9H228 398 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CPNE7Q9UBL6 633 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 D6RAR5 112 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SULT1C2O00338 296 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SIGLEC6O43699 453 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NSA2O95478 260 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINA3P01011 423 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-DOBP13765 273 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MFAP5Q13361 173 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CCINQ13939 588 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNPRQ8TBG9 265 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF721Q8TF20 911 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EDAQ92838 391 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PIK3IP1Q96FE7 263 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FAHD2AQ96GK7 314 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CTSFQ9UBX1 484 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO4Q9UKT5 387 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PR77 199 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM171A2A8MVW0 826 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IL33O95760 270 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4E1P0C645 316 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MGMTP16455 207 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF3P17036 446 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL1P22362 96 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CTHP32929 405 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP6V1E1P36543 226 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF84P51523 738 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SGCBQ16585 318 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TSSK4Q6SA08 328 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DRAM2Q6UX65 266 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 C17orf107Q6ZR85 190 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GKN2Q86XP6 184 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF679Q8IYX0 411 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NUBPLQ8TB37 319 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CUTCQ9NTM9 273 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM206AQ9NX38 181 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS20P59510 1910 aa3.24□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM218A2RU14 115 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM235A6NFC5 223 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FKTNO75072 461 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ADH1BP00325 375 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TTRP02766 147 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT33BQ14525 404 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSWIM7Q19AV6 140 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 APCDD1LQ8NCL9 501 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4C6Q8NH72 309 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GRHL3Q8TE85 626 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TAAR9Q96RI9 348 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HDHD2Q9H0R4 259 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DOCK7Q96N67 2140 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHG1P01857 330 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CNR1P21554 472 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CMPK1P30085 196 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MAS1LP35410 378 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTR1BP42025 376 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTR1AP61163 376 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ACKR1Q16570 336 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EMC4Q5J8M3 183 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM31Q5JXX7 168 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD13Q7L211 337 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM8Q96KF7 97 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MOSPD1Q9UJG1 213 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR132Q9UNW8 380 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF814B7Z6K7 855 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MFNGO00587 321 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SEMA4FO95754 770 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 WASP42768 502 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EGR3Q06889 387 aa3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms