RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 BTBD10Q9BSF8 475 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 MAGIXQ9H6Y5 334 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 EGLN3Q9H6Z9 239 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 REV1Q9UBZ9 1251 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 A0A096LNT2 108 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 INAFM1C9JVW0 142 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 ACOT8O14734 319 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 SYNGR3O43761 229 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 CCNB2O95067 398 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 SNAP29O95721 258 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 GPANK1O95872 356 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 TXNDC12O95881 172 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 CSF3P09919 207 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 WNT5AP41221 380 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 HMGA2P52926 109 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 PCBD1P61457 104 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 TSPAN31Q12999 210 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 SPATA46Q5T0L3 261 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 LEG1Q6P5S2 330 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF620Q6ZNG0 422 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 ADCK1Q86TW2 530 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 JAZF1Q86VZ6 243 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF101Q8IZC7 436 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 OR1J1Q8NGS3 322 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 OR4K13Q8NH42 304 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 POM121Q96HA1 1249 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 NMNAT3Q96T66 252 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 LYNX1G3V0Z9 82 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 AHCYL1O43865 530 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 STAMBPO95630 424 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 GASTP01350 101 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 TP53P04637 393 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 LYNX1P0DP58 116 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 NAT2P11245 290 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 DAOP14920 347 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC25A16P16260 332 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 NOS3P29474 1203 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 RAD52P43351 418 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 EVX1P49640 407 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 GLO1Q04760 184 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 GGTLC2Q14390 218 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 GLB1L2Q8IW92 636 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 PIMREGQ9BSJ6 248 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 FN3KQ9H479 309 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 REEP1Q9H902 201 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 FN1P02751 2386 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP15.59■□□□□ 0.09
PTPRN2-204ENST00000404321 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 DCTN6O00399 190 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 APEHP13798 732 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ERFP50548 548 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 NKPD1Q17RQ9 610 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 OR2T5Q6IEZ7 315 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 SDR9C7Q8NEX9 313 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 OR2T29Q8NH02 315 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 SYNPRQ8TBG9 265 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 C11orf40Q8WZ69 217 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 BCL2L14Q9BZR8 327 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 TRIM15Q9C019 465 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 TAAR3PQ9P1P4 343 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ASH2LQ9UBL3 628 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 NAV3Q8IVL0 2385 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ARPC3O15145 178 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 DOK2O60496 412 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 RAP2AP10114 183 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 USF1P22415 310 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 HTR5AP47898 357 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 MEP1BQ16820 701 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ADGRG5Q8IZF4 528 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 OR6V1Q8N148 313 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ABHD4Q8TB40 342 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 CHID1Q9BWS9 393 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 POLR1DQ9Y2S0 133 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 CDH10Q9Y6N8 788 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 HIVEP2P31629 2446 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRN2-204ENST00000404321 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms