RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF700Q9H0M5 742 aa11.17□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 PCBD2Q9H0N5 130 aa11.17□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 NELFAQ9H3P2 528 aa11.17□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 BCO1Q9HAY6 547 aa11.17□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 HCSTQ9UBK5 93 aa11.17□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 CACFD1Q9UGQ2 172 aa11.17□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 PI3P19957 117 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 C5AR1P21730 350 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 CHATP28329 748 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 C10orf91Q5T1B1 145 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 OR10AC1Q8NH08 325 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 SEH1LQ96EE3 360 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 OR2M4Q96R27 311 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 ATG101Q9BSB4 218 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 SLC17A9Q9BYT1 436 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 GMFGO60234 142 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 TBX19O60806 448 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 AKR1A1P14550 325 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 GRK6P43250 576 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 UBE2KP61086 200 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 DRAM2Q6UX65 266 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 CCDC74AQ96AQ1 378 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 VSIG4Q9Y279 399 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 K7EPK0 472 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 ADAP1O75689 374 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 SFTPCP11686 197 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 HOXA5P20719 270 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 HTR2CP28335 458 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 GNALP38405 381 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 SLC11A1P49279 550 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 MAP2K5Q13163 448 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 DUSP5Q16690 384 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 DPY19L4Q7Z388 723 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 MARCH1Q8TCQ1 289 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 ROBO4Q8WZ75 1007 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 SLC41A2Q96JW4 573 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1B0GWA3 101 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM127O75204 238 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 EOMESO95936 686 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 IGHV2-5P01817 119 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 SPOCK1Q08629 439 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 TCEA2Q15560 299 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 OTPQ5XKR4 325 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 OR51A4Q8NGJ6 313 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF563Q8TA94 476 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 CXorf40AQ8TE69 158 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 GPX8Q8TED1 209 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 PELI2Q9HAT8 420 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 PRR13Q9NZ81 148 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 LUZP4Q9P127 313 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 CYB5BO43169 146 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 TACR3P29371 465 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 IGFALSP35858 605 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 OR3A2P47893 321 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 DUSP2Q05923 314 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 MLC1Q15049 377 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 MFSD12Q6NUT3 480 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF619Q8N2I2 560 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 PRSS27Q9BQR3 290 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 TRIM2Q9C040 744 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa11.15□□□□□ -0.62
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1B0GTI1 187 aa11.15□□□□□ -0.63
SZRD1-201ENST00000401088 MSGN1A6NI15 193 aa11.15□□□□□ -0.63
SZRD1-201ENST00000401088 H7C1C5 153 aa11.15□□□□□ -0.63
SZRD1-201ENST00000401088 SOX15O60248 233 aa11.15□□□□□ -0.63
SZRD1-201ENST00000401088 DOK2O60496 412 aa11.15□□□□□ -0.63
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
SZRD1-201ENST00000401088 GABRA3P34903 492 aa11.15□□□□□ -0.63
SZRD1-201ENST00000401088 TSFMP43897 325 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
SZRD1-201ENST00000401088 CX3CR1P49238 355 aa11.15□□□□□ -0.63
SZRD1-201ENST00000401088 LCN6P62502 163 aa11.15□□□□□ -0.63
SZRD1-201ENST00000401088 RAB1AP62820 205 aa11.15□□□□□ -0.63
SZRD1-201ENST00000401088 C1orf189Q5VU69 101 aa11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms